More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6870 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
206 aa  414  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  68.45 
 
 
206 aa  293  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.73 
 
 
116 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  49.06 
 
 
106 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  47.62 
 
 
107 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  49.06 
 
 
106 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  44.04 
 
 
123 aa  94  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
119 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  45.71 
 
 
107 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
119 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
106 aa  92.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
116 aa  92.4  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
113 aa  92.8  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.5 
 
 
121 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.3 
 
 
122 aa  92.4  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.3 
 
 
122 aa  92.4  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
109 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.37 
 
 
117 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  40.37 
 
 
123 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
106 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  46.23 
 
 
106 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.37 
 
 
118 aa  88.6  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.37 
 
 
106 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.64 
 
 
115 aa  88.6  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.12 
 
 
121 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.59 
 
 
106 aa  87.8  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4805  hesB/yadR/yfhF family protein  37.19 
 
 
130 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4646  hypothetical protein  37.19 
 
 
130 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4666  hypothetical protein  37.19 
 
 
130 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
106 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
106 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3951  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.64 
 
 
118 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5073  hesB/yadR/yfhF family protein  37.19 
 
 
130 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.99 
 
 
110 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5044  hesB/yadR/yfhF family protein  37.93 
 
 
117 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.81 
 
 
106 aa  87  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  37.93 
 
 
117 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  37.93 
 
 
117 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  37.93 
 
 
117 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.99 
 
 
110 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.91 
 
 
106 aa  86.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.66 
 
 
120 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0493  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.18 
 
 
114 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  44.76 
 
 
110 aa  86.3  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  42.99 
 
 
110 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3609  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
116 aa  86.3  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  40.57 
 
 
123 aa  86.3  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  37.96 
 
 
141 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1343  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
124 aa  86.3  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  40.17 
 
 
126 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  40.17 
 
 
126 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0167  hesB/yadR/yfhF family protein  37.07 
 
 
117 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  40.74 
 
 
106 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.74 
 
 
106 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
114 aa  85.9  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.44 
 
 
124 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.53 
 
 
109 aa  85.5  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.66 
 
 
110 aa  85.5  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  44.04 
 
 
122 aa  85.1  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0954  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.66 
 
 
133 aa  85.1  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.557942  normal  0.360876 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.32 
 
 
118 aa  84.7  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.21 
 
 
117 aa  84.7  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.45 
 
 
117 aa  84.7  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12230  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
130 aa  84  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.40084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.32 
 
 
126 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0203  HesB/YadR/YfhF  40.54 
 
 
118 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4552  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.04 
 
 
138 aa  84  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.685133  normal  0.324174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1531  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.18 
 
 
111 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.182474  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  40.57 
 
 
107 aa  84  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.18 
 
 
111 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.7 
 
 
127 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.38 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0952421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.7 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  40 
 
 
107 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  36.7 
 
 
127 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2752  HesB/YadR/YfhF  40 
 
 
110 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  40.35 
 
 
117 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.73 
 
 
107 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.37 
 
 
121 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  40.57 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  40.57 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.09 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  40.57 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  40.57 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  40.57 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2797  HesB/YadR/YfhF  40 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0272946  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.12 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  40.57 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.19 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  40.57 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  40.57 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2665  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.72 
 
 
117 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840353  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  38.18 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3392  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.61 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1867  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.84 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0627654  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>