More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1525 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1525  HesB/YadR/YfhF-family protein  100 
 
 		 195 aa  401  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1888  HesB/YadR/YfhF  64.58 
 
 		 196 aa  274  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28760  NfuA protein  64.95 
 
 		 194 aa  272  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3445  hypothetical protein  63.4 
 
 		 194 aa  271  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40630  hypothetical protein  63.4 
 
 		 194 aa  271  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2344  HesB/YadR/YfhF-family protein  64.21 
 
 		 193 aa  267  8.999999999999999e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2378  yhgI protein  64.43 
 
 		 194 aa  254  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0102502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3317  HesB/YadR/YfhF-family protein  64.43 
 
 		 194 aa  254  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1985  IscR-regulated protein YhgI  63.92 
 
 		 194 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.858904  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2161  HesB/YadR/YfhF-family protein  64.43 
 
 		 194 aa  252  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0420771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1891  IscR-regulated protein YhgI  63.4 
 
 		 194 aa  251  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1847  HesB/YadR/YfhF-family protein  58.67 
 
 		 216 aa  245  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000308783 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2009  hypothetical protein  58.64 
 
 		 203 aa  244  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1911  hypothetical protein  57.14 
 
 		 227 aa  243  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392795  hitchhiker  0.00108913 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2202  HesB/YadR/YfhF  57.14 
 
 		 257 aa  243  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20209  decreased coverage  0.00866489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3104  HesB/YadR/YfhF  59.79 
 
 		 194 aa  240  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2735  yhgI protein  59.39 
 
 		 197 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2466  HesB/YadR/YfhF:nitrogen-fixing NifU, C-terminal  59.39 
 
 		 197 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0790017  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0234  putative DNA uptake protein  52.6 
 
 		 191 aa  226  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0316  putative DNA uptake protein  52.6 
 
 		 191 aa  225  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4634  putative DNA uptake protein  51.56 
 
 		 191 aa  221  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3926  putative DNA uptake protein  52.08 
 
 		 191 aa  221  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3750  putative DNA uptake protein  51.56 
 
 		 191 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0163  putative DNA uptake protein  51.56 
 
 		 191 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3990  putative DNA uptake protein  51.56 
 
 		 191 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3819  putative DNA uptake protein  52.6 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3881  putative DNA uptake protein  52.6 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3710  putative DNA uptake protein  52.6 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.238496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3785  putative DNA uptake protein  52.6 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3713  putative DNA uptake protein  52.6 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4119  putative DNA uptake protein  51.56 
 
 		 191 aa  218  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03266  predicted gluconate transport associated protein  51.56 
 
 		 191 aa  217  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00179798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0299  IscR-regulated protein YhgI  51.56 
 
 		 191 aa  217  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044435  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  51.56 
 
 		 191 aa  217  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3889  putative DNA uptake protein  51.56 
 
 		 191 aa  217  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03218  hypothetical protein  51.56 
 
 		 191 aa  217  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00164281  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4721  putative DNA uptake protein  51.56 
 
 		 191 aa  217  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0299  putative DNA uptake protein  51.56 
 
 		 191 aa  217  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00815707  normal  0.0446785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3611  putative DNA uptake protein  51.56 
 
 		 191 aa  217  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3795  putative DNA uptake protein  51.56 
 
 		 191 aa  217  8.999999999999998e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3827  putative DNA uptake protein  50 
 
 		 191 aa  215  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001879  NfuA Fe-S protein maturation  50.77 
 
 		 194 aa  214  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00614  putative DNA uptake protein  50.26 
 
 		 194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0142  putative DNA uptake protein  51.04 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4192  putative DNA uptake protein  51.04 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2911  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4125  putative DNA uptake protein  51.04 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4324  putative DNA uptake protein  51.04 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3880  putative DNA uptake protein  51.04 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4619  putative DNA uptake protein  51.04 
 
 		 192 aa  208  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3794  putative DNA uptake protein  50.52 
 
 		 192 aa  207  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100459  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3804  putative DNA uptake protein  51.04 
 
 		 192 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.472358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4003  putative DNA uptake protein  51.04 
 
 		 192 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2293  putative DNA uptake protein  50 
 
 		 195 aa  206  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1491  putative DNA uptake protein  48.44 
 
 		 193 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241637  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4010  putative DNA uptake protein  48.44 
 
 		 192 aa  204  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03996  putative DNA uptake protein  48.7 
 
 		 192 aa  204  8e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0220  putative DNA uptake protein  48.7 
 
 		 192 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.722098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0179  putative DNA uptake protein  47.92 
 
 		 192 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0244  putative DNA uptake protein  48.44 
 
 		 192 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0106  putative DNA uptake protein  48.44 
 
 		 192 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.790621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4233  putative DNA uptake protein  47.67 
 
 		 192 aa  198  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3202  putative DNA uptake protein  48.97 
 
 		 193 aa  198  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0161749 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0159  putative DNA uptake protein  47.4 
 
 		 192 aa  197  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3528  putative DNA uptake protein  48.44 
 
 		 192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3502  putative DNA uptake protein  46.88 
 
 		 192 aa  193  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.840353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2673  HesB/YadR/YfhF-family protein  44.79 
 
 		 199 aa  174  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114695 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0484  yhgI protein  41.15 
 
 		 190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.508791  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2172  thioredoxin-like protein  44.79 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01524  protein GntY  43.23 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2084  HesB/YadR/YfhF-family protein  44.27 
 
 		 199 aa  168  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.92431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2457  HesB/YadR/YfhF-family protein  36.98 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172331  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1723  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.86 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  50 
 
 		 311 aa  68.2  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  44 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  40.85 
 
 		 73 aa  64.3  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.66 
 
 		 73 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.03 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  45.83 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  40.54 
 
 		 76 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  45.21 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.66 
 
 		 301 aa  62  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  43.66 
 
 		 296 aa  62  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  46.77 
 
 		 73 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.85 
 
 		 73 aa  62  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  49.15 
 
 		 289 aa  61.6  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.44 
 
 		 309 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.79 
 
 		 74 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.44 
 
 		 73 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  27.78 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  40.24 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.89 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4600  nitrogen-fixing NifU-like  45.83 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  42.25 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.84 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.89 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.17 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.84 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  43.06 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  44.44 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>