271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1847 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1847  HesB/YadR/YfhF-family protein  100 
 
 		 216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000308783 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1911  hypothetical protein  88.04 
 
 		 227 aa  390  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392795  hitchhiker  0.00108913 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2202  HesB/YadR/YfhF  88.52 
 
 		 257 aa  391  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20209  decreased coverage  0.00866489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3445  hypothetical protein  60.41 
 
 		 194 aa  245  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40630  hypothetical protein  60.41 
 
 		 194 aa  245  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1525  HesB/YadR/YfhF-family protein  58.67 
 
 		 195 aa  245  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1888  HesB/YadR/YfhF  57.65 
 
 		 196 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28760  NfuA protein  57.87 
 
 		 194 aa  235  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2009  hypothetical protein  55.1 
 
 		 203 aa  231  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2344  HesB/YadR/YfhF-family protein  56.41 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2161  HesB/YadR/YfhF-family protein  59.39 
 
 		 194 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0420771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1985  IscR-regulated protein YhgI  58.88 
 
 		 194 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.858904  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1891  IscR-regulated protein YhgI  58.38 
 
 		 194 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2378  yhgI protein  58.38 
 
 		 194 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0102502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2735  yhgI protein  58.46 
 
 		 197 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2466  HesB/YadR/YfhF:nitrogen-fixing NifU, C-terminal  58.46 
 
 		 197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0790017  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3317  HesB/YadR/YfhF-family protein  58.38 
 
 		 194 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3104  HesB/YadR/YfhF  58.46 
 
 		 194 aa  218  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0234  putative DNA uptake protein  52.82 
 
 		 191 aa  201  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0316  putative DNA uptake protein  52.31 
 
 		 191 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3750  putative DNA uptake protein  52.31 
 
 		 191 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3990  putative DNA uptake protein  52.31 
 
 		 191 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0163  putative DNA uptake protein  52.31 
 
 		 191 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4119  putative DNA uptake protein  51.28 
 
 		 191 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03266  predicted gluconate transport associated protein  51.28 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00179798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0299  IscR-regulated protein YhgI  51.28 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044435  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3889  putative DNA uptake protein  51.28 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0299  putative DNA uptake protein  51.28 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00815707  normal  0.0446785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3827  putative DNA uptake protein  50.26 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3611  putative DNA uptake protein  51.28 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4721  putative DNA uptake protein  51.28 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3795  putative DNA uptake protein  51.28 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03218  hypothetical protein  51.28 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00164281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  51.28 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3819  putative DNA uptake protein  51.28 
 
 		 191 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3713  putative DNA uptake protein  51.28 
 
 		 191 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3881  putative DNA uptake protein  51.28 
 
 		 191 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4634  putative DNA uptake protein  49.74 
 
 		 191 aa  195  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3785  putative DNA uptake protein  51.28 
 
 		 191 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3710  putative DNA uptake protein  51.28 
 
 		 191 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.238496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3926  putative DNA uptake protein  50.77 
 
 		 191 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2293  putative DNA uptake protein  48.98 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001879  NfuA Fe-S protein maturation  48.99 
 
 		 194 aa  191  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00614  putative DNA uptake protein  47.47 
 
 		 194 aa  187  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0159  putative DNA uptake protein  49.23 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0106  putative DNA uptake protein  49.74 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.790621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4192  putative DNA uptake protein  50.77 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0142  putative DNA uptake protein  50.77 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4324  putative DNA uptake protein  50.77 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3880  putative DNA uptake protein  49.74 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4125  putative DNA uptake protein  50.77 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3794  putative DNA uptake protein  50.26 
 
 		 192 aa  185  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100459  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0244  putative DNA uptake protein  49.23 
 
 		 192 aa  185  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2911  putative DNA uptake protein  47.47 
 
 		 194 aa  185  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0179  putative DNA uptake protein  48.21 
 
 		 192 aa  185  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4619  putative DNA uptake protein  50.26 
 
 		 192 aa  185  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3502  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 192 aa  184  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.840353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4233  putative DNA uptake protein  47.45 
 
 		 192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3804  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.472358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4003  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4010  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03996  putative DNA uptake protein  48.47 
 
 		 192 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3528  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 192 aa  178  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0220  putative DNA uptake protein  44.39 
 
 		 192 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.722098  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1491  putative DNA uptake protein  45.92 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241637  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3202  putative DNA uptake protein  44.16 
 
 		 193 aa  167  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0161749 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0484  yhgI protein  40.51 
 
 		 190 aa  154  1e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.508791  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2673  HesB/YadR/YfhF-family protein  40 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114695 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01524  protein GntY  38.97 
 
 		 199 aa  141  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2457  HesB/YadR/YfhF-family protein  39.9 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172331  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2172  thioredoxin-like protein  38.46 
 
 		 199 aa  134  8e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2084  HesB/YadR/YfhF-family protein  38.46 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.92431  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1723  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.42 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  27.94 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  28.43 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  38.96 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.42 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  39.19 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.62 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.84 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.07 
 
 		 121 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  36.84 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  41.27 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  33.33 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  38.46 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  42.19 
 
 		 75 aa  52.8  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  36.71 
 
 		 80 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.21 
 
 		 306 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.31 
 
 		 77 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  39.73 
 
 		 81 aa  52.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  36.25 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.84 
 
 		 309 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  34.18 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  42.03 
 
 		 103 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.91 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  34.18 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.04 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.57 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  33.75 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  33.75 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>