115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2457 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2457  HesB/YadR/YfhF-family protein  100 
 
 		 211 aa  430  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172331  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0106  putative DNA uptake protein  41.97 
 
 		 192 aa  154  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.790621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4010  putative DNA uptake protein  41.24 
 
 		 192 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0159  putative DNA uptake protein  41.75 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1888  HesB/YadR/YfhF  41.12 
 
 		 196 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0316  putative DNA uptake protein  39.9 
 
 		 191 aa  148  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3926  putative DNA uptake protein  38.54 
 
 		 191 aa  148  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03996  putative DNA uptake protein  42.27 
 
 		 192 aa  148  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40630  hypothetical protein  40.1 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3445  hypothetical protein  40.1 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4233  putative DNA uptake protein  40.72 
 
 		 192 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3880  putative DNA uptake protein  39.58 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3502  putative DNA uptake protein  40.93 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.840353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3528  putative DNA uptake protein  40.93 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3794  putative DNA uptake protein  40.1 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4119  putative DNA uptake protein  38.54 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4619  putative DNA uptake protein  40.62 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0179  putative DNA uptake protein  40.72 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0142  putative DNA uptake protein  39.58 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4192  putative DNA uptake protein  39.58 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4324  putative DNA uptake protein  39.58 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4125  putative DNA uptake protein  39.58 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3827  putative DNA uptake protein  39.38 
 
 		 191 aa  145  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0234  putative DNA uptake protein  39.9 
 
 		 191 aa  145  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0244  putative DNA uptake protein  39.58 
 
 		 192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3990  putative DNA uptake protein  37.5 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3750  putative DNA uptake protein  37.5 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0163  putative DNA uptake protein  37.5 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03266  predicted gluconate transport associated protein  39.38 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00179798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0299  IscR-regulated protein YhgI  39.38 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044435  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3611  putative DNA uptake protein  39.38 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3889  putative DNA uptake protein  39.38 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0299  putative DNA uptake protein  39.38 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00815707  normal  0.0446785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  39.38 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3795  putative DNA uptake protein  39.38 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4721  putative DNA uptake protein  39.38 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03218  hypothetical protein  39.38 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00164281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3804  putative DNA uptake protein  39.9 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.472358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4003  putative DNA uptake protein  39.9 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28760  NfuA protein  39.58 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3202  putative DNA uptake protein  38.66 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0161749 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4634  putative DNA uptake protein  36.98 
 
 		 191 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3785  putative DNA uptake protein  38.86 
 
 		 191 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3819  putative DNA uptake protein  38.86 
 
 		 191 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3710  putative DNA uptake protein  38.86 
 
 		 191 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.238496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3713  putative DNA uptake protein  38.86 
 
 		 191 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3881  putative DNA uptake protein  38.86 
 
 		 191 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1491  putative DNA uptake protein  39.69 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2009  hypothetical protein  35.57 
 
 		 203 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2673  HesB/YadR/YfhF-family protein  39.9 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114695 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1911  hypothetical protein  37.69 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392795  hitchhiker  0.00108913 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2202  HesB/YadR/YfhF  37.69 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20209  decreased coverage  0.00866489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1525  HesB/YadR/YfhF-family protein  36.98 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1847  HesB/YadR/YfhF-family protein  39.9 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000308783 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2293  putative DNA uptake protein  37.88 
 
 		 195 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2344  HesB/YadR/YfhF-family protein  36.65 
 
 		 193 aa  134  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112883 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2911  putative DNA uptake protein  35.05 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0220  putative DNA uptake protein  37.63 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.722098  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01524  protein GntY  36.98 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001879  NfuA Fe-S protein maturation  36.6 
 
 		 194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00614  putative DNA uptake protein  36.6 
 
 		 194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2172  thioredoxin-like protein  36.46 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2084  HesB/YadR/YfhF-family protein  36.46 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.92431  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0484  yhgI protein  34.38 
 
 		 190 aa  121  7e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.508791  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2161  HesB/YadR/YfhF-family protein  39.06 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0420771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3104  HesB/YadR/YfhF  38.02 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2378  yhgI protein  37.5 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0102502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3317  HesB/YadR/YfhF-family protein  37.5 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1985  IscR-regulated protein YhgI  37.5 
 
 		 194 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.858904  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1891  IscR-regulated protein YhgI  36.98 
 
 		 194 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2735  yhgI protein  36.41 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2466  HesB/YadR/YfhF:nitrogen-fixing NifU, C-terminal  36.41 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0790017  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1723  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.34 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  28.64 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.26 
 
 		 285 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  37.04 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0249  HesB/YadR/YfhF family protein  28.28 
 
 		 128 aa  49.3  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.25 
 
 		 306 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3067  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.5 
 
 		 129 aa  45.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.46 
 
 		 290 aa  45.4  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0908  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.61 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3815  hypothetical protein  31.46 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473897  normal  0.0339082 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.81 
 
 		 87 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  37.5 
 
 		 76 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  28.12 
 
 		 106 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.12 
 
 		 106 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  32 
 
 		 103 aa  42.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.12 
 
 		 117 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.12 
 
 		 105 aa  42.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5073  hesB/yadR/yfhF family protein  27.08 
 
 		 130 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.31 
 
 		 77 aa  42.4  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  27.08 
 
 		 117 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2270  nitrogen-fixing NifU-like  29.85 
 
 		 99 aa  42.4  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.228591  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3328  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  28.12 
 
 		 114 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0992  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  28.12 
 
 		 114 aa  42.4  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3457  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  28.12 
 
 		 114 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.549303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01609  HesB protein family  30.21 
 
 		 116 aa  42.4  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  27.08 
 
 		 117 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  27.08 
 
 		 117 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>