266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2466 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2466  HesB/YadR/YfhF:nitrogen-fixing NifU, C-terminal  100 
 
 		 197 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0790017  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2735  yhgI protein  99.49 
 
 		 197 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3104  HesB/YadR/YfhF  93.91 
 
 		 194 aa  356  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3445  hypothetical protein  82.74 
 
 		 194 aa  343  8e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40630  hypothetical protein  82.74 
 
 		 194 aa  343  8e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1985  IscR-regulated protein YhgI  87.82 
 
 		 194 aa  337  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.858904  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2378  yhgI protein  87.31 
 
 		 194 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0102502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3317  HesB/YadR/YfhF-family protein  87.31 
 
 		 194 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1891  IscR-regulated protein YhgI  87.82 
 
 		 194 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2161  HesB/YadR/YfhF-family protein  84.26 
 
 		 194 aa  322  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0420771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28760  NfuA protein  75.13 
 
 		 194 aa  315  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1888  HesB/YadR/YfhF  64.43 
 
 		 196 aa  275  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1525  HesB/YadR/YfhF-family protein  59.39 
 
 		 195 aa  262  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2344  HesB/YadR/YfhF-family protein  57.51 
 
 		 193 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112883 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1847  HesB/YadR/YfhF-family protein  58.46 
 
 		 216 aa  240  7.999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000308783 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2009  hypothetical protein  57.22 
 
 		 203 aa  240  7.999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2202  HesB/YadR/YfhF  56.92 
 
 		 257 aa  235  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20209  decreased coverage  0.00866489 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1911  hypothetical protein  56.92 
 
 		 227 aa  235  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392795  hitchhiker  0.00108913 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0234  putative DNA uptake protein  50 
 
 		 191 aa  205  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3827  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 191 aa  203  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4634  putative DNA uptake protein  48.97 
 
 		 191 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0316  putative DNA uptake protein  48.97 
 
 		 191 aa  202  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3750  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 191 aa  202  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0163  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 191 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3990  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 191 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3926  putative DNA uptake protein  48.45 
 
 		 191 aa  200  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2911  putative DNA uptake protein  48.48 
 
 		 194 aa  200  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4119  putative DNA uptake protein  48.45 
 
 		 191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03266  predicted gluconate transport associated protein  49.48 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00179798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0299  IscR-regulated protein YhgI  49.48 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044435  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3795  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4721  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03218  hypothetical protein  49.48 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00164281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3889  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3611  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3880  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 192 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0299  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00815707  normal  0.0446785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3710  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 191 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.238496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3785  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 191 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4125  putative DNA uptake protein  50.52 
 
 		 192 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0142  putative DNA uptake protein  50.52 
 
 		 192 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3881  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 191 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4192  putative DNA uptake protein  50.52 
 
 		 192 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4324  putative DNA uptake protein  50.52 
 
 		 192 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3819  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 191 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3713  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 191 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0244  putative DNA uptake protein  50 
 
 		 192 aa  197  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0106  putative DNA uptake protein  51.03 
 
 		 192 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.790621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3794  putative DNA uptake protein  50 
 
 		 192 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100459  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4619  putative DNA uptake protein  50 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0179  putative DNA uptake protein  50 
 
 		 192 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3804  putative DNA uptake protein  48.97 
 
 		 192 aa  194  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.472358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4003  putative DNA uptake protein  48.97 
 
 		 192 aa  194  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001879  NfuA Fe-S protein maturation  47.98 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2293  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 195 aa  193  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0159  putative DNA uptake protein  48.97 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4010  putative DNA uptake protein  49.48 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00614  putative DNA uptake protein  47.98 
 
 		 194 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3528  putative DNA uptake protein  48.45 
 
 		 192 aa  191  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03996  putative DNA uptake protein  49.23 
 
 		 192 aa  191  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4233  putative DNA uptake protein  48.21 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0220  putative DNA uptake protein  46.15 
 
 		 192 aa  187  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.722098  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1491  putative DNA uptake protein  47.69 
 
 		 193 aa  184  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241637  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3502  putative DNA uptake protein  47.42 
 
 		 192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.840353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3202  putative DNA uptake protein  44.62 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0161749 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0484  yhgI protein  40.72 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.508791  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2673  HesB/YadR/YfhF-family protein  40.21 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114695 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01524  protein GntY  40.21 
 
 		 199 aa  151  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2172  thioredoxin-like protein  39.69 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2084  HesB/YadR/YfhF-family protein  39.18 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.92431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2457  HesB/YadR/YfhF-family protein  36.41 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172331  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1723  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.53 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.06 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  43.24 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.42 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.9 
 
 		 87 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  39.29 
 
 		 80 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.91 
 
 		 285 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  36.36 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  36.36 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 289 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  40.26 
 
 		 76 aa  52  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  42.11 
 
 		 75 aa  51.2  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.84 
 
 		 73 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  34.78 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  35.53 
 
 		 76 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  33.33 
 
 		 311 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  35 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.71 
 
 		 77 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  34.57 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.78 
 
 		 301 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  33.78 
 
 		 296 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.85 
 
 		 286 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  36.25 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  35 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  36.25 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  37.88 
 
 		 72 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  35 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  36.36 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>