146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0484 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0484  yhgI protein  100 
 
 
190 aa  387  1e-107  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.508791  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0316  putative DNA uptake protein  59.69 
 
 
191 aa  249  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4634  putative DNA uptake protein  59.69 
 
 
191 aa  248  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3926  putative DNA uptake protein  60.21 
 
 
191 aa  247  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0234  putative DNA uptake protein  59.16 
 
 
191 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4119  putative DNA uptake protein  60.21 
 
 
191 aa  245  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3990  putative DNA uptake protein  59.16 
 
 
191 aa  243  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3750  putative DNA uptake protein  59.16 
 
 
191 aa  243  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0163  putative DNA uptake protein  59.16 
 
 
191 aa  243  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03266  predicted gluconate transport associated protein  58.64 
 
 
191 aa  239  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00179798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0299  IscR-regulated protein YhgI  58.64 
 
 
191 aa  239  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044435  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4721  putative DNA uptake protein  58.64 
 
 
191 aa  239  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03218  hypothetical protein  58.64 
 
 
191 aa  239  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00164281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3611  putative DNA uptake protein  58.64 
 
 
191 aa  239  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3889  putative DNA uptake protein  58.64 
 
 
191 aa  239  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0299  putative DNA uptake protein  58.64 
 
 
191 aa  239  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00815707  normal  0.0446785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  58.64 
 
 
191 aa  239  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3795  putative DNA uptake protein  58.64 
 
 
191 aa  239  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3827  putative DNA uptake protein  57.59 
 
 
191 aa  237  8e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3713  putative DNA uptake protein  57.59 
 
 
191 aa  235  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3881  putative DNA uptake protein  57.59 
 
 
191 aa  235  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3785  putative DNA uptake protein  57.59 
 
 
191 aa  235  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3819  putative DNA uptake protein  57.59 
 
 
191 aa  235  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3710  putative DNA uptake protein  57.59 
 
 
191 aa  235  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.238496  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0106  putative DNA uptake protein  54.45 
 
 
192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.790621  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3880  putative DNA uptake protein  52.88 
 
 
192 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03996  putative DNA uptake protein  51.56 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0179  putative DNA uptake protein  52.88 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3804  putative DNA uptake protein  52.88 
 
 
192 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.472358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4003  putative DNA uptake protein  52.88 
 
 
192 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860921  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0244  putative DNA uptake protein  51.83 
 
 
192 aa  210  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0159  putative DNA uptake protein  52.88 
 
 
192 aa  210  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4125  putative DNA uptake protein  51.83 
 
 
192 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0142  putative DNA uptake protein  51.83 
 
 
192 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3794  putative DNA uptake protein  51.83 
 
 
192 aa  210  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100459  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4192  putative DNA uptake protein  51.83 
 
 
192 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4324  putative DNA uptake protein  51.83 
 
 
192 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4010  putative DNA uptake protein  51.31 
 
 
192 aa  208  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2911  putative DNA uptake protein  52.36 
 
 
194 aa  207  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4619  putative DNA uptake protein  51.31 
 
 
192 aa  207  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3502  putative DNA uptake protein  51.31 
 
 
192 aa  207  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.840353  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3528  putative DNA uptake protein  51.83 
 
 
192 aa  207  9e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4233  putative DNA uptake protein  53.12 
 
 
192 aa  204  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001879  NfuA Fe-S protein maturation  50.79 
 
 
194 aa  204  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1491  putative DNA uptake protein  49.21 
 
 
193 aa  203  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00614  putative DNA uptake protein  49.74 
 
 
194 aa  201  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0220  putative DNA uptake protein  47.92 
 
 
192 aa  201  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.722098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3202  putative DNA uptake protein  51.04 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0161749 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2293  putative DNA uptake protein  49.74 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1888  HesB/YadR/YfhF  43.46 
 
 
196 aa  177  9e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28760  NfuA protein  44.79 
 
 
194 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1525  HesB/YadR/YfhF-family protein  41.15 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40630  hypothetical protein  40.84 
 
 
194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3445  hypothetical protein  40.84 
 
 
194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2009  hypothetical protein  40.84 
 
 
203 aa  162  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2344  HesB/YadR/YfhF-family protein  40.53 
 
 
193 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0112883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2161  HesB/YadR/YfhF-family protein  42.41 
 
 
194 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0420771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3104  HesB/YadR/YfhF  42.93 
 
 
194 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1847  HesB/YadR/YfhF-family protein  40.51 
 
 
216 aa  154  9e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000308783 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1911  hypothetical protein  39.49 
 
 
227 aa  152  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392795  hitchhiker  0.00108913 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2202  HesB/YadR/YfhF  39.49 
 
 
257 aa  152  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20209  decreased coverage  0.00866489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2378  yhgI protein  41.88 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0102502  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3317  HesB/YadR/YfhF-family protein  41.88 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0770851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1985  IscR-regulated protein YhgI  41.88 
 
 
194 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.858904  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1891  IscR-regulated protein YhgI  41.88 
 
 
194 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2735  yhgI protein  40.72 
 
 
197 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2466  HesB/YadR/YfhF:nitrogen-fixing NifU, C-terminal  40.72 
 
 
197 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0790017  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2673  HesB/YadR/YfhF-family protein  36.46 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114695 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01524  protein GntY  34.59 
 
 
199 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2457  HesB/YadR/YfhF-family protein  34.38 
 
 
211 aa  121  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172331  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2172  thioredoxin-like protein  33.33 
 
 
199 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2084  HesB/YadR/YfhF-family protein  33.33 
 
 
199 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.92431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.58 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1723  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.48 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  44.59 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.47 
 
 
87 aa  63.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  39.44 
 
 
73 aa  58.9  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.67 
 
 
286 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 
73 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.92 
 
 
73 aa  54.7  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  30.1 
 
 
311 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  34.72 
 
 
291 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.03 
 
 
73 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  34.38 
 
 
289 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.1 
 
 
79 aa  52  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.57 
 
 
77 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.76 
 
 
74 aa  51.2  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  27.8 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.32 
 
 
72 aa  50.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.1 
 
 
88 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  36.62 
 
 
74 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.53 
 
 
96 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  34.92 
 
 
75 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.03 
 
 
306 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  36.62 
 
 
74 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  39.68 
 
 
103 aa  48.9  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  36.62 
 
 
73 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.88 
 
 
86 aa  48.5  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  32 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.88 
 
 
86 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>