More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2369 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 285 aa  560  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  56.79 
 
 		 289 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.81 
 
 		 286 aa  259  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  48 
 
 		 291 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  32.95 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.25 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.25 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  27.4 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.41 
 
 		 290 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.62 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  34.88 
 
 		 311 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.58 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  32.58 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.07 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3815  hypothetical protein  39.49 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473897  normal  0.0339082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  35.6 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  35.6 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  35.6 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  31.85 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0484  yhgI protein  44.58 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.508791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2413  NifU domain-containing protein  30.37 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0708227  normal  0.256977 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4600  nitrogen-fixing NifU-like  33.55 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.12 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4634  putative DNA uptake protein  49.18 
 
 		 191 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.53 
 
 		 73 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4119  putative DNA uptake protein  49.18 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.52 
 
 		 109 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0814  benzene 1,2-dioxygenase, ferredoxin protein  33.33 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  49.23 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.43 
 
 		 99 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3926  putative DNA uptake protein  45.9 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2526  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.86 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.0193911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3502  putative DNA uptake protein  51.79 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.840353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3990  putative DNA uptake protein  45.9 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3750  putative DNA uptake protein  45.9 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0163  putative DNA uptake protein  45.9 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3827  putative DNA uptake protein  44.26 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.93 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0234  putative DNA uptake protein  44.26 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0316  putative DNA uptake protein  44.26 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1525  HesB/YadR/YfhF-family protein  43.48 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2293  putative DNA uptake protein  50 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03266  predicted gluconate transport associated protein  44.26 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00179798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0299  IscR-regulated protein YhgI  44.26 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044435  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0299  putative DNA uptake protein  44.26 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00815707  normal  0.0446785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3713  putative DNA uptake protein  44.26 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3785  putative DNA uptake protein  44.26 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3795  putative DNA uptake protein  44.26 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3881  putative DNA uptake protein  44.26 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3819  putative DNA uptake protein  44.26 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0159  putative DNA uptake protein  46.43 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  44.26 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3611  putative DNA uptake protein  44.26 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4721  putative DNA uptake protein  44.26 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4010  putative DNA uptake protein  41.43 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  34.69 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3710  putative DNA uptake protein  44.26 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.238496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  43.28 
 
 		 75 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3889  putative DNA uptake protein  44.26 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03218  hypothetical protein  44.26 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00164281  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.19 
 
 		 79 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4593  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.22 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  48.53 
 
 		 75 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4762  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.65 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00614  putative DNA uptake protein  55 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  41.54 
 
 		 80 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09103  apoptosis-inducing factor (Eurofung)  31.91 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0266985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0179  putative DNA uptake protein  44.64 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3445  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0106  putative DNA uptake protein  44.64 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.790621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2344  HesB/YadR/YfhF-family protein  45 
 
 		 193 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40630  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  44.78 
 
 		 72 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.13 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.84 
 
 		 523 aa  56.2  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  43.08 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.07 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001879  NfuA Fe-S protein maturation  51.67 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.03 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  46.03 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3528  putative DNA uptake protein  48.08 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.69 
 
 		 79 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.59 
 
 		 73 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28760  NfuA protein  44.07 
 
 		 194 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  38.03 
 
 		 88 aa  54.3  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  37.1 
 
 		 186 aa  54.3  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  42.31 
 
 		 84 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.31 
 
 		 86 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  39.34 
 
 		 183 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  36.23 
 
 		 74 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01524  protein GntY  43.28 
 
 		 199 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.78 
 
 		 86 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  54.35 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  43.75 
 
 		 74 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.71 
 
 		 137 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.71 
 
 		 107 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2911  putative DNA uptake protein  50 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  38.57 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  42.31 
 
 		 86 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  40.3 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>