212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2129 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  100 
 
 
294 aa  573  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  97.96 
 
 
294 aa  534  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  97.96 
 
 
294 aa  534  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2413  NifU domain-containing protein  62.12 
 
 
297 aa  325  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0708227  normal  0.256977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.41 
 
 
306 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3815  hypothetical protein  40.12 
 
 
186 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473897  normal  0.0339082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  32.4 
 
 
291 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.8 
 
 
290 aa  95.9  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4593  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.14 
 
 
206 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.08 
 
 
286 aa  89  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  30.86 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  35.6 
 
 
296 aa  85.5  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.6 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  29.3 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  25.46 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.07 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.64 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.64 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.87 
 
 
309 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  38.1 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4600  nitrogen-fixing NifU-like  36.97 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357598  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  27.83 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  42.86 
 
 
81 aa  69.3  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.12 
 
 
76 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 
79 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 
79 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  45.59 
 
 
76 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  45.31 
 
 
80 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.94 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  45.95 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  45.59 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  44.93 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.14 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.14 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.14 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  47.14 
 
 
86 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.71 
 
 
86 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.84 
 
 
96 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  47.14 
 
 
89 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  36 
 
 
79 aa  64.3  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 
86 aa  63.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  44.44 
 
 
79 aa  62.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  36.84 
 
 
78 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  36.84 
 
 
78 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  36.84 
 
 
78 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  36.84 
 
 
78 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  36.84 
 
 
78 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  36.84 
 
 
78 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  36.84 
 
 
78 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  36.84 
 
 
78 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  39.13 
 
 
81 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  36.84 
 
 
78 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  43.28 
 
 
86 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  36.92 
 
 
81 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  39.13 
 
 
81 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  36.84 
 
 
78 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  39.13 
 
 
81 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  37.68 
 
 
81 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  39.13 
 
 
81 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  37.68 
 
 
81 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.45 
 
 
85 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  39.13 
 
 
81 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  37.68 
 
 
81 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  39.13 
 
 
81 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.54 
 
 
77 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  35.06 
 
 
78 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.1 
 
 
73 aa  59.3  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  36.76 
 
 
186 aa  59.3  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  39.34 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08130  hypothetical protein  34.16 
 
 
172 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  35.06 
 
 
103 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.67 
 
 
81 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.5 
 
 
78 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 
74 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.5 
 
 
78 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  39.19 
 
 
186 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  39.19 
 
 
186 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.57 
 
 
72 aa  57  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  37.84 
 
 
186 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.82 
 
 
73 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  31.9 
 
 
186 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  33.93 
 
 
187 aa  55.8  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2491  hypothetical protein  29.52 
 
 
202 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98493  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  32.43 
 
 
183 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  27.81 
 
 
187 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  29.13 
 
 
190 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  31.94 
 
 
72 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  31.86 
 
 
186 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  39.13 
 
 
188 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  39.66 
 
 
186 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  36.99 
 
 
187 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  35.62 
 
 
184 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  33.33 
 
 
72 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  38.03 
 
 
187 aa  54.3  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0047  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.14 
 
 
81 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.62 
 
 
73 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  32.71 
 
 
187 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  37.14 
 
 
75 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  35.82 
 
 
73 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  33.33 
 
 
190 aa  52.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>