253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2413 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2413  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 297 aa  584  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0708227  normal  0.256977 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  63.14 
 
 		 294 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  63.14 
 
 		 294 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  62.12 
 
 		 294 aa  323  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.78 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3815  hypothetical protein  48.45 
 
 		 186 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473897  normal  0.0339082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  31.6 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.09 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.2 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  30.91 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4593  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.21 
 
 		 206 aa  92  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  26.46 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.98 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.13 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  23.04 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  26.49 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  42.11 
 
 		 78 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  42.11 
 
 		 78 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  42.11 
 
 		 78 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  42.11 
 
 		 78 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  42.11 
 
 		 78 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  42.11 
 
 		 78 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  42.11 
 
 		 78 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  42.11 
 
 		 78 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  42.11 
 
 		 78 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  42.11 
 
 		 78 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  35.42 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.42 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  42.25 
 
 		 78 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  25.99 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.65 
 
 		 88 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  25.99 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4600  nitrogen-fixing NifU-like  36.57 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.14 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.06 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  36.51 
 
 		 173 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  43.06 
 
 		 80 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.06 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.06 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  42.47 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  51.43 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  43.06 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.89 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.43 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  50 
 
 		 84 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1943  nitrogen-fixing NifU-like  36.49 
 
 		 191 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 86 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.57 
 
 		 86 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  39.13 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  37.68 
 
 		 80 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  40.28 
 
 		 81 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  37.68 
 
 		 80 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.83 
 
 		 96 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  43.84 
 
 		 86 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.14 
 
 		 86 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.46 
 
 		 78 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.3 
 
 		 72 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.57 
 
 		 86 aa  64.3  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  43.84 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.29 
 
 		 73 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  36.23 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  41.43 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  48.57 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.76 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  39.39 
 
 		 189 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  37.68 
 
 		 103 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  37.68 
 
 		 81 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  37.68 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 85 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  36.11 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  37.68 
 
 		 81 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  37.68 
 
 		 81 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  36.11 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  37.68 
 
 		 81 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  37.68 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  36.11 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0047  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.33 
 
 		 81 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  37.88 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  34.78 
 
 		 81 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  37.5 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  36.11 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  39.71 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.71 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  36.23 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  36.62 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  37.5 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  34.78 
 
 		 81 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  34.78 
 
 		 81 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  34.78 
 
 		 81 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  37.31 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  38.67 
 
 		 188 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  35.21 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  43.06 
 
 		 75 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  34.78 
 
 		 81 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  36 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  42.62 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  41.94 
 
 		 74 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  42.62 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  39.13 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>