207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1070 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 
76 aa  154  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  44.59 
 
 
74 aa  68.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.89 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  43.66 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  45.71 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  43.24 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.89 
 
 
200 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  45.83 
 
 
206 aa  67.8  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  45.59 
 
 
195 aa  67  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  47.3 
 
 
74 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  42.25 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  41.43 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  42.86 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  41.43 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  41.43 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  41.43 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  42.65 
 
 
242 aa  63.9  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.73 
 
 
74 aa  63.5  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  50 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  40.58 
 
 
192 aa  63.2  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  36.49 
 
 
185 aa  62.8  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  41.43 
 
 
195 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  42.47 
 
 
191 aa  61.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  40.85 
 
 
187 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.1 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  46.48 
 
 
76 aa  61.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  39.19 
 
 
103 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  38.36 
 
 
186 aa  60.5  0.000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  39.19 
 
 
72 aa  60.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  37.68 
 
 
187 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  40.28 
 
 
190 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.28 
 
 
73 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  40.28 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  42.03 
 
 
188 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.28 
 
 
73 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  42.03 
 
 
188 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  38.03 
 
 
188 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  41.67 
 
 
73 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  42.03 
 
 
188 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  40.28 
 
 
190 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  40.28 
 
 
190 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  40 
 
 
192 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  48.28 
 
 
326 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  40.58 
 
 
188 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  42.03 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.84 
 
 
183 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  38.57 
 
 
189 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  40.28 
 
 
74 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.84 
 
 
198 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  36.62 
 
 
201 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  42.03 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  37.68 
 
 
186 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  42.03 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  38.03 
 
 
191 aa  58.2  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  44.44 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  38.36 
 
 
186 aa  57.8  0.00000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  40.28 
 
 
73 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  41.43 
 
 
183 aa  57  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  43.55 
 
 
188 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  37.5 
 
 
74 aa  57  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  44.44 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  44.44 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.5 
 
 
73 aa  57  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  41.94 
 
 
188 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.5 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  33.8 
 
 
187 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.16 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.89 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  41.1 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  41.1 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.67 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  40.32 
 
 
188 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  35.71 
 
 
189 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  40.28 
 
 
72 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  39.71 
 
 
188 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  39.71 
 
 
188 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.62 
 
 
72 aa  55.1  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  39.13 
 
 
186 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  40 
 
 
254 aa  54.7  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  41.67 
 
 
190 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.13 
 
 
294 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.13 
 
 
294 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  41.67 
 
 
191 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  33.78 
 
 
180 aa  53.9  0.0000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.84 
 
 
73 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.27 
 
 
309 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.27 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.39 
 
 
300 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  37.14 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  35.94 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  38.71 
 
 
173 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.88 
 
 
296 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.99 
 
 
73 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.27 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  38.98 
 
 
305 aa  51.6  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  37.93 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>