240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1492 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 109 aa  219  8e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.14 
 
 		 74 aa  75.5  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.28 
 
 		 73 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.28 
 
 		 73 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  49.28 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  49.28 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  49.28 
 
 		 74 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  50.72 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.14 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  50.72 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  47.83 
 
 		 73 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.05 
 
 		 77 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  50.7 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.71 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  47.83 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  43.75 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  45.71 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  45.33 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  42.5 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  42.5 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  42.5 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  42.5 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.61 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  42.5 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  42.5 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  42.5 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  42.5 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  42.5 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.79 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  48.61 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  42.5 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.43 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  44.29 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.21 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.67 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  42.86 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.1 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  46.48 
 
 		 75 aa  60.1  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  40.51 
 
 		 242 aa  60.1  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  41.18 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  39.44 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.93 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  45.07 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  42.65 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  41.67 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  44.29 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  44.29 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  37.5 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02790  NifU C-terminal domain-containing protein, VnfU  56.36 
 
 		 96 aa  57  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.18 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.84 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.84 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.57 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  44.93 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  42.86 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  42.86 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  37.21 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  41.56 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.83 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.56 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0061  NifU family protein  37.21 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.269629  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  40.26 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.06 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.15 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.15 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  40 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  40.58 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.03 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.71 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  38.81 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.94 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9865  predicted protein  39.68 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07223  normal  0.100166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  39.13 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  40.24 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.08 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  37.68 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  37.68 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  43.75 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  37.68 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1875  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.87 
 
 		 299 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  37.68 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  37.68 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  37.68 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  38.81 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  45.59 
 
 		 188 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  42.47 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  44.12 
 
 		 188 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  35.96 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.88 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  40.98 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.96 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.54 
 
 		 300 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  36.76 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0047  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.62 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  38.03 
 
 		 190 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  40.38 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  39.39 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  38.03 
 
 		 190 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>