160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5908 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5908  putative nifU protein  100 
 
 		 96 aa  190  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0107  NifU domain-containing protein  69.57 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.826994 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.56 
 
 		 344 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.6 
 
 		 328 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  53.16 
 
 		 312 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  53.42 
 
 		 338 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  50 
 
 		 331 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0484  NifU domain-containing protein  48.61 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.07 
 
 		 309 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  50.72 
 
 		 333 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.5 
 
 		 329 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  44.44 
 
 		 291 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.44 
 
 		 291 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2183  NifU domain-containing protein  46.15 
 
 		 246 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0531  nitrogen fixation protein  46.15 
 
 		 246 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.035039  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1256  NifU domain-containing protein  46.15 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.94 
 
 		 298 aa  73.9  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2270  nitrogen-fixing NifU-like  48.48 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.228591  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  45.59 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49030  NifU C-terminal domain-containing protein, AnfU  42.86 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.99 
 
 		 277 aa  57.8  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02790  NifU C-terminal domain-containing protein, VnfU  35.71 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1875  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.3 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.94 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.45 
 
 		 281 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.48 
 
 		 309 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.76 
 
 		 280 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.19 
 
 		 281 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.21 
 
 		 291 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.94 
 
 		 277 aa  53.9  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  40.79 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.17 
 
 		 276 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  42.65 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.55 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9865  predicted protein  46.77 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07223  normal  0.100166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.46 
 
 		 294 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  41.18 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.33 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  41.18 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.83 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.1 
 
 		 283 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.43 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.46 
 
 		 294 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.94 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.8 
 
 		 281 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.94 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  43.33 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.94 
 
 		 306 aa  50.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  44 
 
 		 186 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.67 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  41.94 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.03 
 
 		 86 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  39.47 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.71 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.5 
 
 		 278 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  36.05 
 
 		 289 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  39.58 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  40.91 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.33 
 
 		 300 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  43.33 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  39.71 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  40.32 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  39.47 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  39.71 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  39.71 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  39.71 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1302  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.56 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0063306  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.58 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  45.45 
 
 		 76 aa  48.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  38.16 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  43.33 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  38.24 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  38.71 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  38.24 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  44.9 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  50.94 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.57 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.16 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  43.75 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.16 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  47.83 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.14 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.67 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.02 
 
 		 293 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.71 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  41.1 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.58 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  42.86 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.8 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1483  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.78 
 
 		 281 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.530906  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  37.14 
 
 		 311 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.71 
 
 		 285 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  41.07 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  41.07 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.58 
 
 		 284 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.02 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  34.48 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  44.68 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>