More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4477 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 
206 aa  411  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  68.45 
 
 
206 aa  293  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  47.66 
 
 
107 aa  99.4  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
122 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
122 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.22 
 
 
106 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
106 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.3 
 
 
106 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.82 
 
 
119 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.82 
 
 
119 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0493  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.54 
 
 
114 aa  90.9  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2770  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
108 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.67 
 
 
117 aa  89.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 
109 aa  89.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.99 
 
 
141 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.07 
 
 
118 aa  89  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  44.23 
 
 
126 aa  88.2  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  40.18 
 
 
130 aa  87.8  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  40.18 
 
 
122 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
108 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  43.27 
 
 
106 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.38 
 
 
121 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  41.67 
 
 
109 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
108 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3701  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
108 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0875  HesB/YadR/YfhF family protein  39.05 
 
 
108 aa  85.9  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.699772  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3392  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
108 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0866  HesB/YadR/YfhF family protein  39.05 
 
 
108 aa  85.9  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.1 
 
 
116 aa  86.3  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.72 
 
 
110 aa  85.9  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  40 
 
 
127 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0751  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.79 
 
 
107 aa  84.7  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118128  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
108 aa  84.7  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.86 
 
 
116 aa  84.7  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.12 
 
 
117 aa  84.7  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.52 
 
 
124 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1531  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.86 
 
 
111 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.182474  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.86 
 
 
111 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3609  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
116 aa  84.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  40.37 
 
 
110 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
127 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2525  HesB/YadR/YfhF  39.66 
 
 
126 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00201416  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
127 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  40 
 
 
141 aa  84  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  42.06 
 
 
107 aa  84  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1011  HesB/YadR/YfhF  39.64 
 
 
116 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.752752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3912  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.59 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.74 
 
 
120 aa  83.6  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.2 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.324909  hitchhiker  0.0039414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2752  HesB/YadR/YfhF  41.82 
 
 
110 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  42.31 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2797  HesB/YadR/YfhF  41.28 
 
 
110 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0272946  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3155  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.68 
 
 
118 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.96 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  36.52 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12230  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.40084  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0954  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.73 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.557942  normal  0.360876 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  38.98 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0901  HesB/YadR/YfhF  43.27 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  37.3 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2218  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.59 
 
 
129 aa  82  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0238312  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.78 
 
 
110 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  41.35 
 
 
126 aa  82  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1664  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.69 
 
 
121 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.138511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3125  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.37 
 
 
110 aa  82  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185787  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  41.35 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.07 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2084  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.24 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  41.35 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.91 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.75 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1955  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
128 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000220764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  39.13 
 
 
123 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1650  HesB/YadR/YfhF  34.29 
 
 
107 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.14 
 
 
108 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1781  HesB/YadR/YfhF  46.25 
 
 
124 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  35.24 
 
 
117 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2752  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  40.38 
 
 
123 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203289  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.71 
 
 
116 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.96 
 
 
120 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0658  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.33 
 
 
110 aa  80.1  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.393107  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
106 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3261  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.34 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0203  HesB/YadR/YfhF  37.04 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3020  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.12 
 
 
116 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.21 
 
 
118 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1362  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.14 
 
 
139 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.67 
 
 
118 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  decreased coverage  0.00532589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  40.57 
 
 
106 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.19 
 
 
108 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1756  HesB/YadR/YfhF  39.45 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3951  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.33 
 
 
118 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3829  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.1 
 
 
110 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.1 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.9 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15600  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.52 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.722466  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4426  hypothetical protein  39.81 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.939817  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.74 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>