More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0869 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0869  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 134 aa  276  5e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45.97 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.9 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  45.9 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.14 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  45.83 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.14 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  45.45 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  46.67 
 
 		 144 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  44.63 
 
 		 146 aa  116  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  46.67 
 
 		 142 aa  116  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  44.63 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  46.28 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  47.54 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  46.28 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.2 
 
 		 207 aa  114  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  47.41 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.28 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  43.33 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  43.9 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.22 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  46.55 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  45.69 
 
 		 144 aa  110  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  43.8 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  47.86 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.59 
 
 		 283 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.34 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  44.63 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  43.59 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.33 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  45.76 
 
 		 211 aa  101  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.83 
 
 		 286 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.97 
 
 		 284 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  40.83 
 
 		 211 aa  98.2  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.97 
 
 		 284 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  40.34 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.53 
 
 		 291 aa  97.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  41.53 
 
 		 291 aa  97.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.53 
 
 		 284 aa  96.3  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.55 
 
 		 290 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  41.38 
 
 		 163 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  41.27 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  48.28 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.74 
 
 		 277 aa  94  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  41.67 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.5 
 
 		 133 aa  94  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.5 
 
 		 133 aa  94  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  40.38 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  44.83 
 
 		 285 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.5 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  44.63 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  41.67 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  41.94 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  40.83 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  41.94 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  40.48 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  43.33 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2605  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.38 
 
 		 153 aa  90.5  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000897774  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.97 
 
 		 286 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1443  scaffold protein  43.75 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0899521  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.83 
 
 		 133 aa  90.9  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.24 
 
 		 281 aa  90.1  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.1 
 
 		 288 aa  89.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.98 
 
 		 344 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  41.6 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  38.1 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  38.89 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.5 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  39.84 
 
 		 150 aa  88.6  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  42.5 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  40.8 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.94 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  38.26 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  42.98 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  42.98 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.74 
 
 		 281 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  42.15 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  42.98 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  42.98 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  42.98 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  40.8 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  40.8 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  42.98 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.5 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.68 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  39.52 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  42.15 
 
 		 128 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  42.5 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  35.34 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  38.58 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.5 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  39.37 
 
 		 138 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  40 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  41.13 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  40 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  41.13 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.16 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  41.13 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  41.67 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>