More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0303 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
100 aa  209  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  81.82 
 
 
99 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  77.78 
 
 
100 aa  168  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  68 
 
 
100 aa  152  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  66 
 
 
100 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61 
 
 
99 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  57.14 
 
 
98 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  57.73 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3700  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.04 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3687  Rieske (2Fe-2S) region  33.04 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3760  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.04 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.64 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.73 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
123 aa  67  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.82 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.89 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1967  Rieske (2Fe-2S) region  36.46 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0966264  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1911  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.46 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1996  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.42 
 
 
100 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.664018  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0311  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.73 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.62 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.67 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  31.87 
 
 
291 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2251  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.42 
 
 
104 aa  60.1  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.322428  normal  0.209318 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  30.61 
 
 
311 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.11 
 
 
521 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1142  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.54 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209918  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4721  Rieske (2Fe-2S) region  35.64 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5395  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  38.27 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.37 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2066  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.42 
 
 
121 aa  58.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.87 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1079  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.31 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0175517  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  32.29 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3247  Rieske (2Fe-2S) region  32.32 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206921  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  33.68 
 
 
238 aa  57  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2879  nitrite reductase (NAD(P)H)subunit  35.35 
 
 
971 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.14 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  31.13 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.12 
 
 
286 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  35.35 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.35 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.87 
 
 
290 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  35.35 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2964  hypothetical protein  26.47 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  39.51 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2265  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.04 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  35.35 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  35.35 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  35.35 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.25 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00226382  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  35.35 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  35.35 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.17 
 
 
289 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.11 
 
 
289 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0534  Rieske (2Fe-2S) region  30.97 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.85 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.89 
 
 
521 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0589  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.92 
 
 
112 aa  53.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.61 
 
 
594 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  34.04 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2814  hypothetical protein  25.74 
 
 
117 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1672  hypothetical protein  32.99 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  30.11 
 
 
270 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  31.52 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2135  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.99 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.52 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.95 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2815  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.07 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717991 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.63 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4263  hypothetical protein  26.92 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.603078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  28.89 
 
 
289 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  36.59 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2731  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.43 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20873  normal  0.962551 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  29.7 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2796  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.61 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.67 
 
 
309 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.42 
 
 
509 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.65 
 
 
112 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  34.74 
 
 
521 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.53 
 
 
102 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5690  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.93 
 
 
104 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1739  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.5 
 
 
101 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5508  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.69 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.66 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1694  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.99 
 
 
105 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4115  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  39.34 
 
 
127 aa  50.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.063358  normal  0.0248701 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2068  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.95 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360129  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1331  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  30.39 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2057  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  30.1 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2308  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  27.37 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619497  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  37.33 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  30.61 
 
 
599 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  36.36 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3131  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  28.28 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>