More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7180 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
114 aa  229  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.49 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2815  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.81 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  43.75 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4263  hypothetical protein  49.44 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.603078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.81 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1911  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.43 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1996  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.43 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.664018  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2249  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  34.51 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1482  Rieske (2Fe-2S) region  50.72 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.27 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0434  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  43.14 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1967  Rieske (2Fe-2S) region  39.77 
 
 
96 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0966264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  44.12 
 
 
106 aa  67  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4762  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.62 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  42.11 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.68 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0965  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.93 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00646524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.98 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  38.46 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  34.62 
 
 
110 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1326  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.6 
 
 
108 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.710748  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.96 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  38.95 
 
 
102 aa  62  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0940  putative Rieske (2Fe-2S) ferredoxin  33.03 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.46 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.96 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3700  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.07 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.19 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.28 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1282  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.24 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.580287  normal  0.705623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3687  Rieske (2Fe-2S) region  28.07 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4283  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.64 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0344911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3760  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.07 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.19 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.31 
 
 
105 aa  60.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.71 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18750  phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  43.96 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485806  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3866  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.63 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34.02 
 
 
105 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  38.18 
 
 
238 aa  60.5  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  34.86 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  34.86 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0994  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.18 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.86 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  33.71 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34.02 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2151  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34.02 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.981833  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1739  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.61 
 
 
101 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  34.02 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  34.02 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34.02 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2246  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.69 
 
 
109 aa  58.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00879762  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0207  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.02 
 
 
105 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1987  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.45 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.74 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2315  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.791717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.04 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.53 
 
 
649 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  36.56 
 
 
104 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.89 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  33.33 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5347  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210101  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.03 
 
 
101 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  40.23 
 
 
656 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0130  Rieske (2Fe-2S) protein  30.69 
 
 
106 aa  57  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5395  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  42.25 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  32.35 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.89 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  36.11 
 
 
345 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1119  anthranilate dioxygenase ferredoxin subunit(AndAb)  33.02 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.53 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0167  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.78 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000930652 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6339  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.63 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.515952 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.11 
 
 
518 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  28.57 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5690  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.22 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  32.93 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.66 
 
 
326 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0463  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  32.74 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0795  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.65 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.17 
 
 
122 aa  54.7  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1110  anthranilate dioxygenase ferredoxin reductase(AndAb)  32.41 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662253  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3274  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.65 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  40.48 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.48 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  40.48 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  40.48 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  40.48 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  36.36 
 
 
437 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1001  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.63 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  40.48 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  40.48 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  40.48 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  28.87 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.31 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  30.97 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>