More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2673 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 		 649 aa  1344    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  55.35 
 
 		 656 aa  749    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  36.38 
 
 		 591 aa  373  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1930  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.98 
 
 		 529 aa  364  2e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  34 
 
 		 589 aa  356  6.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  35.45 
 
 		 566 aa  332  9e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  35.57 
 
 		 566 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  35.26 
 
 		 566 aa  329  9e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  34.95 
 
 		 566 aa  327  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  34.77 
 
 		 566 aa  323  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.09 
 
 		 549 aa  302  1e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1818  pyruvate oxidase  34.33 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0736  pyruvate dehydrogenase [cytochrome]  33.14 
 
 		 563 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  30.59 
 
 		 584 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4042  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.26 
 
 		 605 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2151  pyruvate oxidase  32.29 
 
 		 584 aa  263  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6370  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  31 
 
 		 599 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.529318 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  28.92 
 
 		 579 aa  259  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  28.92 
 
 		 579 aa  259  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3372  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.41 
 
 		 576 aa  257  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08220  pyruvate oxidase  30.1 
 
 		 534 aa  254  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5572  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  30.37 
 
 		 600 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307179 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.5 
 
 		 554 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.24 
 
 		 588 aa  253  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  30.29 
 
 		 576 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2115  pyruvate oxidase  28.52 
 
 		 579 aa  244  3e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1387  pyruvate dehydrogenase  29.61 
 
 		 572 aa  241  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  31.56 
 
 		 566 aa  240  6.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0784  thiamine pyrophosphate protein  30.98 
 
 		 608 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.45 
 
 		 581 aa  239  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2294  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.06 
 
 		 578 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.879055  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0946  thiamine pyrophosphate protein  30.82 
 
 		 744 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217897  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0471  thiamine pyrophosphate protein  32.06 
 
 		 601 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0772  thiamine pyrophosphate protein  30.98 
 
 		 608 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0548988  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2031  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.11 
 
 		 578 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2979  thiamine pyrophosphate protein  31.52 
 
 		 595 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0396438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.21 
 
 		 587 aa  237  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.75 
 
 		 593 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0076  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.49 
 
 		 596 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.686266 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  30.06 
 
 		 578 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401078  normal  0.110885 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1032  pyruvate dehydrogenase  28.41 
 
 		 572 aa  237  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2436  thiamine pyrophosphate protein  31.28 
 
 		 595 aa  237  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262777  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.63 
 
 		 557 aa  236  8e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2460  pyruvate dehydrogenase  28.22 
 
 		 572 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0975  pyruvate dehydrogenase  28.22 
 
 		 572 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0068  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.32 
 
 		 596 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.736165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.18 
 
 		 565 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0203  pyruvate dehydrogenase  28.84 
 
 		 576 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0234842 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0900  pyruvate dehydrogenase  28.22 
 
 		 572 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2966  thiamine pyrophosphate protein  31.16 
 
 		 595 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482904 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1467  thiamine pyrophosphate protein  31.31 
 
 		 588 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37340  thiamine pyrophosphate protein  29.84 
 
 		 590 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000027158  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00876  pyruvate dehydrogenase  28.04 
 
 		 572 aa  234  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.688216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2771  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.04 
 
 		 572 aa  234  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2725  pyruvate dehydrogenase  28.04 
 
 		 572 aa  234  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.26 
 
 		 561 aa  234  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00882  hypothetical protein  28.04 
 
 		 572 aa  234  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.731415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0944  pyruvate dehydrogenase  28.04 
 
 		 572 aa  234  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  28.31 
 
 		 576 aa  234  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.09 
 
 		 581 aa  233  6e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.28 
 
 		 557 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1564  pyruvate dehydrogenase  28.52 
 
 		 577 aa  233  9e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48094  normal  0.707647 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.38 
 
 		 552 aa  233  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1843  pyruvate dehydrogenase  28.33 
 
 		 577 aa  233  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528367  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.36 
 
 		 552 aa  233  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5492  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.49 
 
 		 597 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2249  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  30.35 
 
 		 579 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0404885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.67 
 
 		 548 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.59 
 
 		 553 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.36 
 
 		 574 aa  231  3e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.23 
 
 		 586 aa  231  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3203  thiamine pyrophosphate protein  29.66 
 
 		 590 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.71 
 
 		 619 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0972  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.4 
 
 		 581 aa  231  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0024  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.65 
 
 		 578 aa  231  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.338176  normal  0.262087 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2619  pyruvate dehydrogenase  27.32 
 
 		 573 aa  231  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2732  thiamine pyrophosphate protein  30.8 
 
 		 596 aa  230  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0935  pyruvate dehydrogenase  27.96 
 
 		 572 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05821  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.19 
 
 		 587 aa  230  6e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.449821  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  30.28 
 
 		 567 aa  230  7e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1589  pyruvate dehydrogenase  27.32 
 
 		 573 aa  229  9e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.49 
 
 		 535 aa  229  9e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2703  pyruvate dehydrogenase  27.78 
 
 		 573 aa  229  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1664  pyruvate dehydrogenase  27.89 
 
 		 573 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265267  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05901  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.03 
 
 		 587 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.96 
 
 		 558 aa  229  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.07 
 
 		 566 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.95 
 
 		 570 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1002  pyruvate dehydrogenase  27.78 
 
 		 572 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1033  pyruvate dehydrogenase  27.78 
 
 		 572 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.12 
 
 		 579 aa  228  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6128  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.74 
 
 		 579 aa  228  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0970  pyruvate dehydrogenase  27.78 
 
 		 572 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  29.06 
 
 		 566 aa  228  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2788  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.48 
 
 		 578 aa  227  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.987771  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  30.89 
 
 		 587 aa  227  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  29.23 
 
 		 562 aa  227  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.21 
 
 		 548 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3419  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.51 
 
 		 579 aa  227  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1052  pyruvate dehydrogenase  27.78 
 
 		 572 aa  227  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>