More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4522 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
116 aa  238  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  60 
 
 
116 aa  153  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  59.13 
 
 
116 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  56.9 
 
 
116 aa  151  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  56.03 
 
 
118 aa  144  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2964  hypothetical protein  46.23 
 
 
117 aa  117  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2814  hypothetical protein  46.23 
 
 
117 aa  117  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.43 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6175  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.64 
 
 
593 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659991  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.08 
 
 
594 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2066  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.51 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86880  predicted protein  30.97 
 
 
238 aa  62.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.73 
 
 
521 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  31.58 
 
 
102 aa  60.8  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.83 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.57 
 
 
114 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.86 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.78 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3441  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.54 
 
 
599 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26520  predicted protein  49.25 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.36 
 
 
290 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  36.99 
 
 
270 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  29.2 
 
 
291 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  34.26 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  26.61 
 
 
604 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2265  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.22 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.07 
 
 
112 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.59 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  26.96 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  34.67 
 
 
311 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4288  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.47 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2251  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.17 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.322428  normal  0.209318 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.12 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  35.62 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0130  Rieske (2Fe-2S) protein  25.86 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.04 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.9 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00196635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.3 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.13 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5347  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.83 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  36.84 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  30.09 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  39.13 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.43 
 
 
504 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.03 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  27.83 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  31.78 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1079  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.35 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0175517  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  28.21 
 
 
112 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00226382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.03 
 
 
289 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  26.32 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47829  predicted protein  26.09 
 
 
479 aa  54.3  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03310  conserved hypothetical protein  35.21 
 
 
585 aa  53.9  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1282  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.580287  normal  0.705623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01479  dioxygenase, ferredoxin reductase component, putative  28.95 
 
 
559 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.38 
 
 
309 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.97 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1001  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  28.7 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4349  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.69 
 
 
516 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504096  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1970  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.77 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5893  nitrite reductase small subunit  37.33 
 
 
111 aa  52  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.36 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5985  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  33.33 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0662  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.34 
 
 
506 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.82 
 
 
286 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41540  assimilatory nitrite reductase small subunit  27.97 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.77 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3526  assimilatory nitrite reductase small subunit  27.97 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.99 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  29.25 
 
 
100 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2693  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 
506 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563055  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.31 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3462  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.96 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2068  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.15 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360129  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2444  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.35 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44307  normal  0.0794581 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0795  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.47 
 
 
105 aa  50.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  28.45 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383279  normal  0.78464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5395  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.67 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2526  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.43 
 
 
350 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.0193911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2955  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  28.7 
 
 
115 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1329  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.72 
 
 
118 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316396  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2669  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.69 
 
 
418 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.612089  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2315  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.89 
 
 
141 aa  50.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.791717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1331  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  25 
 
 
119 aa  50.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.35 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1672  hypothetical protein  37.29 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.76 
 
 
521 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9046  predicted protein  27.97 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40637  predicted protein  31.58 
 
 
510 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1628  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  33.77 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.45 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  28.7 
 
 
238 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.67 
 
 
322 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.5 
 
 
506 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0198905  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0720  Rieske (2Fe-2S) region  27.59 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.457021  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0311  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13360  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  34.78 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.823074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>