More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3443 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
116 aa  239  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  56.52 
 
 
116 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  55.65 
 
 
116 aa  153  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  56.9 
 
 
116 aa  151  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  59.48 
 
 
118 aa  147  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2814  hypothetical protein  48.28 
 
 
117 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2964  hypothetical protein  46.55 
 
 
117 aa  120  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86880  predicted protein  29.66 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.7 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.14 
 
 
518 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.3 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29.46 
 
 
604 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.19 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03310  conserved hypothetical protein  35.14 
 
 
585 aa  64.3  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  30.7 
 
 
291 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.57 
 
 
112 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  27.83 
 
 
102 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.63 
 
 
521 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1088  ferredoxin subunit of A ring-hydroxylating dioxygenase oxidoreductase protein  27.83 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.86 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2265  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.22 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.54 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.84 
 
 
594 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.77 
 
 
101 aa  57.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.74 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00196635  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0997  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.73 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.035917  hitchhiker  0.00920354 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.95 
 
 
286 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6175  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.31 
 
 
593 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659991  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2135  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.7 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5690  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.08 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  28.07 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3778  Rieske (2Fe-2S) region  24.14 
 
 
101 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47829  predicted protein  25.47 
 
 
479 aa  57  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  25 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  25 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  25 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  25 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  25 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  25 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  25 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09103  apoptosis-inducing factor (Eurofung)  33.33 
 
 
561 aa  56.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0266985  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4149  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.96 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26520  predicted protein  45.07 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01479  dioxygenase, ferredoxin reductase component, putative  28.7 
 
 
559 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1194  biphenyl 2,3-dioxygenase ferredoxin subunit (BphA3)  26.96 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889683  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0991  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.220686  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.19 
 
 
158 aa  55.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1329  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.45 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316396  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.66 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  29.82 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  25.83 
 
 
289 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.31 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2315  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.62 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.791717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.21 
 
 
509 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.73 
 
 
526 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  28.32 
 
 
119 aa  53.9  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.6 
 
 
506 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0198905  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1987  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.32 
 
 
108 aa  53.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01974  benzene 1,2-dioxygenase ferredoxin protein  30.17 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0274053  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.14 
 
 
521 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0994  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.17 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0814  benzene 1,2-dioxygenase, ferredoxin protein  28.45 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1110  anthranilate dioxygenase ferredoxin reductase(AndAb)  22.61 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662253  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5407  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  26.23 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347398  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  28.45 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2879  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.64 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.388175  normal  0.0551812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.84 
 
 
322 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1119  anthranilate dioxygenase ferredoxin subunit(AndAb)  22.61 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0662  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.5 
 
 
506 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0965  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.64 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00646524 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.09 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.97 
 
 
374 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5347  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.68 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210101  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6339  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.72 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.515952 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1739  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.06 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5395  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.14 
 
 
105 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1326  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.72 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.710748  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0686  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.72 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3441  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.85 
 
 
599 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.06 
 
 
131 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  25.51 
 
 
100 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.78 
 
 
290 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.35 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.35 
 
 
105 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.38 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  33.33 
 
 
521 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.62 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3462  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.09 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2251  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.14 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.322428  normal  0.209318 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.88 
 
 
289 aa  50.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5838  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.26 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.592792  hitchhiker  0.000871266 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.71 
 
 
527 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144463  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  35.82 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4288  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.27 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>