More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3156 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
158 aa  328  1e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3052  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279296  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.25 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3274  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.72 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  44.16 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.62 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.61 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0167  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.35 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000930652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1393  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  46.58 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2249  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.16 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.22 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.63 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1911  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38 
 
 
100 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  38.24 
 
 
106 aa  63.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2526  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.61 
 
 
350 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.0193911 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0965  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.73 
 
 
100 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00646524 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1861  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.89 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.85 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1996  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38 
 
 
100 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.664018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1967  Rieske (2Fe-2S) region  37 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0966264  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  39 
 
 
102 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39 
 
 
102 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  34.31 
 
 
106 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  37.63 
 
 
604 aa  60.8  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3775  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.42 
 
 
107 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2246  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.76 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00879762  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.58 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1987  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.53 
 
 
296 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  37.21 
 
 
285 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  35.05 
 
 
106 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.05 
 
 
106 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  35.05 
 
 
106 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  35.05 
 
 
106 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  35.05 
 
 
106 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.63 
 
 
509 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  35.05 
 
 
106 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  35.05 
 
 
106 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0130  Rieske (2Fe-2S) protein  32.67 
 
 
106 aa  58.9  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  35.05 
 
 
106 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  29.6 
 
 
291 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.67 
 
 
294 aa  58.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.54 
 
 
101 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1119  anthranilate dioxygenase ferredoxin subunit(AndAb)  30.19 
 
 
107 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3778  Rieske (2Fe-2S) region  27.45 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  31.25 
 
 
98 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0311  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.85 
 
 
105 aa  57  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.72 
 
 
289 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  40 
 
 
811 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.7 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2486  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.29 
 
 
112 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.63 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00196635  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03310  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 
585 aa  55.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.19 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4762  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.42 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.7 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  34.65 
 
 
109 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2057  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  33.66 
 
 
117 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1110  anthranilate dioxygenase ferredoxin reductase(AndAb)  28.97 
 
 
107 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662253  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1235  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.44 
 
 
349 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1282  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.44 
 
 
137 aa  54.3  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.580287  normal  0.705623 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6339  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
125 aa  54.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.515952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 
286 aa  54.3  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3091  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.43 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1649  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
370 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6175  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.89 
 
 
593 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659991  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1676  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
349 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.945696  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  29.81 
 
 
102 aa  53.9  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  32 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2461  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.87 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.601158  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0591  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  30.17 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01479  dioxygenase, ferredoxin reductase component, putative  28.33 
 
 
559 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.71 
 
 
518 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.51 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  28.85 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.68 
 
 
513 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5661  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.9 
 
 
512 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5407  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.69 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347398  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.08 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2671  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.17 
 
 
104 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.506336  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.66 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.72 
 
 
100 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  26.8 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1694  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.41 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  30.56 
 
 
289 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.43 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1331  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  32.71 
 
 
119 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1329  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.7 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316396  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  34.34 
 
 
238 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3222  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
141 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0490977  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1113  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  33.33 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 
521 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0406  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4263  hypothetical protein  29.66 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.603078 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  27.88 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.73 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>