276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2964 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2964  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  240  6e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2814  hypothetical protein  98.28 
 
 
117 aa  237  5e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.55 
 
 
116 aa  120  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  46.23 
 
 
116 aa  117  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  48.57 
 
 
118 aa  117  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.74 
 
 
116 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.74 
 
 
116 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.09 
 
 
604 aa  71.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1672  hypothetical protein  34.48 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86880  predicted protein  31.53 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.46 
 
 
521 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  39.13 
 
 
521 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.37 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  27.03 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.79 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4721  Rieske (2Fe-2S) region  29.46 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.36 
 
 
289 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.47 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.76 
 
 
521 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3081  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.3 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0978825  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5690  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.04 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1861  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.48 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.89 
 
 
100 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2066  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.93 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.78 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  27.27 
 
 
100 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  30.77 
 
 
111 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2135  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.96 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6777  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.11 
 
 
103 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.130934 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  28.7 
 
 
465 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.28 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.88 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3775  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.01 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  27.83 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.97 
 
 
119 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.91 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.85 
 
 
506 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0198905  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  32.26 
 
 
477 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.67 
 
 
100 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1142  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.41 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209918  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0434  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.12 
 
 
105 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.6 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.2 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  34.15 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2338  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.37 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.700788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01479  dioxygenase, ferredoxin reductase component, putative  30.43 
 
 
559 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  25 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  25 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  25 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  25 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  25 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  25 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  25 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.67 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  33.73 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26520  predicted protein  40.22 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4288  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.67 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09103  apoptosis-inducing factor (Eurofung)  33.9 
 
 
561 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0266985  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
509 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9046  predicted protein  28.81 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.93 
 
 
504 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.82 
 
 
322 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1987  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.83 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.04 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.47 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.04 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  32.38 
 
 
296 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4263  hypothetical protein  27.34 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.603078 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.38 
 
 
301 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2444  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.53 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44307  normal  0.0794581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2251  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.03 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.322428  normal  0.209318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21930  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  34.52 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0662  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.38 
 
 
506 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0455  Rieske (2Fe-2S) region  31.33 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3224  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.45 
 
 
411 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.841797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0589  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4349  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.18 
 
 
516 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504096  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2967  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  37.5 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476557  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4586  Rieske (2Fe-2S) region  27.88 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312616  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3777  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.88 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.872692  normal  0.412492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3746  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.88 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108566  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4955  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.88 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519732  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2265  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3462  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.81 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2323  Rieske (2Fe-2S) protein  27.88 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.04 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.7 
 
 
527 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144463  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3441  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.51 
 
 
599 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 
518 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.97 
 
 
118 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.42 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2561  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  26.85 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0205  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  26.85 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.84 
 
 
277 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0981  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  26.85 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1194  biphenyl 2,3-dioxygenase ferredoxin subunit (BphA3)  32.61 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889683  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1393  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.67 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1380  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  26.85 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>