151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2847 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
120 aa  250  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  68.22 
 
 
108 aa  159  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  45.37 
 
 
111 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  40.57 
 
 
110 aa  103  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.55 
 
 
111 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.55 
 
 
111 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  42.73 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  39.81 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.25 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  41.67 
 
 
111 aa  94  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  40.78 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  40.74 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.75 
 
 
103 aa  88.6  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.25 
 
 
131 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.32 
 
 
112 aa  85.5  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.64 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  41.25 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  34.95 
 
 
242 aa  61.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  29.29 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.93 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6323  Rieske (2Fe-2S) region  41.33 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1596  toluene-4-monooxygenase system protein C  32.32 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5508  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.37 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  35.94 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.38 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2768  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.11 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2814  hypothetical protein  34.75 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2964  hypothetical protein  35.04 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3775  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.53 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  29.87 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  34.12 
 
 
353 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0808  carboxymuconolactone decarboxylase  35.06 
 
 
211 aa  48.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 
285 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.67 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2815  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.85 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717991 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  27.72 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.26 
 
 
349 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.37 
 
 
398 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7184  Rieske (2Fe-2S) domain protein, MocE subfamily  35.29 
 
 
104 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00608599  normal  0.029061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1457  MocE Rieske (2Fe-2S)  32.26 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1194  biphenyl 2,3-dioxygenase ferredoxin subunit (BphA3)  31.43 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889683  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  23.58 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  36.89 
 
 
407 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3866  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.61 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  33.33 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383279  normal  0.78464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  31.52 
 
 
465 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  28.36 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.47 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.25 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2308  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  31.34 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619497  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0622  putative Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
314 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0948094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  33 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1663  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.38 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0991  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.02 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.220686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  31.34 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.79 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1088  ferredoxin subunit of A ring-hydroxylating dioxygenase oxidoreductase protein  33.33 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  28.75 
 
 
498 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.49 
 
 
360 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.53 
 
 
509 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0526  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.28 
 
 
321 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.35 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0616  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.62 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.67 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  31.82 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  31.82 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
521 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.17 
 
 
362 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  33.33 
 
 
599 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  31.82 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.82 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.62 
 
 
504 aa  43.5  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  25.86 
 
 
118 aa  43.5  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29.47 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.92 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.37 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.1 
 
 
523 aa  42.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  30.3 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0720  Rieske (2Fe-2S) region  28.79 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.457021  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6029  Rieske (2Fe-2S) domain protein, MocE subfamily  42.86 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510688  normal  0.368717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  27.08 
 
 
347 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29.21 
 
 
604 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32 
 
 
326 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  32.63 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  30.3 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23360  assimilatory nitrite reductase, small subunit  27.36 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0534419  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.73 
 
 
406 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  36.76 
 
 
668 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.41 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.333878  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  31.76 
 
 
345 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5006  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0704074  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.5 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.29 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504578 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2151  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  30.3 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.981833  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  21.33 
 
 
270 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2050  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.99 
 
 
332 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2105  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.99 
 
 
332 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.886658  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.92 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>