More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1314 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
111 aa  229  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  78.38 
 
 
111 aa  191  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  68.47 
 
 
111 aa  175  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  60.36 
 
 
111 aa  160  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  64.55 
 
 
111 aa  158  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  64.55 
 
 
111 aa  158  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  61.82 
 
 
116 aa  154  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.52 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  42.99 
 
 
110 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.37 
 
 
120 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.55 
 
 
131 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1596  toluene-4-monooxygenase system protein C  47.42 
 
 
117 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.69 
 
 
122 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  43.4 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.06 
 
 
112 aa  96.7  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.51 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  35.85 
 
 
126 aa  94.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.86 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  39.42 
 
 
104 aa  88.6  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  41.76 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2198  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40.38 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.42 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  31.13 
 
 
242 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  31.96 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.96 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5508  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.29 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.22 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.98 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.29 
 
 
101 aa  61.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  23.71 
 
 
270 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  35.35 
 
 
110 aa  60.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0965  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.39 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00646524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.42 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  34.74 
 
 
599 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4149  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.25 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.57 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  29.13 
 
 
292 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.59 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.61 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2066  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.33 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
114 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  33 
 
 
521 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0940  putative Rieske (2Fe-2S) ferredoxin  34.07 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  30 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.31 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.67 
 
 
110 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.38 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3775  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.97 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  32.32 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.93 
 
 
604 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.73 
 
 
521 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1194  biphenyl 2,3-dioxygenase ferredoxin subunit (BphA3)  35.24 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889683  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5985  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  35 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2879  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.92 
 
 
107 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.388175  normal  0.0551812 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  27.37 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14640  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  32.26 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.857724  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2814  hypothetical protein  30.51 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23360  assimilatory nitrite reductase, small subunit  29.52 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0534419  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1326  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.710748  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2964  hypothetical protein  30.77 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2840  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  26.47 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.41626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.17 
 
 
114 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  29.59 
 
 
119 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2486  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.91 
 
 
112 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2246  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.72 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00879762  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 
361 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.04 
 
 
509 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1672  hypothetical protein  31.43 
 
 
106 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1970  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.91 
 
 
546 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.17 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  34.41 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 
361 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.73 
 
 
521 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  34.44 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  30.1 
 
 
238 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.58 
 
 
526 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2894  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  30.43 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1847  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000145916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.99 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2151  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  30.43 
 
 
105 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.981833  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1349  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.58 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.203828 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  26.32 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6323  Rieske (2Fe-2S) region  28.71 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2329  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  25.49 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  26.32 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30 
 
 
649 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3274  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.71 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3052  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.59 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  30.43 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  30.43 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  30.48 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1457  MocE Rieske (2Fe-2S)  27.84 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
346 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.07 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1393  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.53 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 
361 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2106  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  26.8 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298831  normal  0.595074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.63 
 
 
513 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>