More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5677 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
116 aa  241  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  92.79 
 
 
111 aa  218  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  92.79 
 
 
111 aa  218  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  61.82 
 
 
111 aa  154  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  62.73 
 
 
111 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  59.09 
 
 
111 aa  149  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  60 
 
 
111 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1596  toluene-4-monooxygenase system protein C  51.52 
 
 
117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  45.79 
 
 
110 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  42.57 
 
 
126 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.44 
 
 
111 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.73 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  43.69 
 
 
108 aa  89.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.89 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.74 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  34.95 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.64 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2198  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.89 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  36.26 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  34.31 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.89 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35.11 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.24 
 
 
521 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  44.93 
 
 
242 aa  61.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.37 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.69 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  39.51 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.29 
 
 
649 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5985  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  32.35 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  33.33 
 
 
599 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  35 
 
 
521 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0940  putative Rieske (2Fe-2S) ferredoxin  33.98 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1326  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.710748  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1970  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.41 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1457  MocE Rieske (2Fe-2S)  32.99 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  31.37 
 
 
475 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  36.14 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  36.14 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  37.04 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  25.77 
 
 
270 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
361 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.57 
 
 
361 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.57 
 
 
361 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2423  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.02 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2471  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.02 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  37.04 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  37.04 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  37.04 
 
 
104 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35 
 
 
521 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  37.04 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 
504 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.56 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
370 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  34.31 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  31 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2151  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  38.27 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.981833  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.31 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.38 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
377 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0526  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.95 
 
 
321 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.31 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  31 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2066  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.26 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0622  putative Rieske (2Fe-2S) protein  37.66 
 
 
314 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0948094 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  32.32 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32 
 
 
518 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34 
 
 
509 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0207  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.94 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13360  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  32.99 
 
 
122 aa  50.8  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.823074  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.22 
 
 
277 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.17 
 
 
289 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  30.91 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.99 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3274  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.17 
 
 
289 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  31.07 
 
 
238 aa  50.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.98 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.29 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.03 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.63 
 
 
513 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0173  Rieske (2Fe-2S) region  36.47 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  35 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.68 
 
 
373 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  37.68 
 
 
371 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.8 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  37.68 
 
 
371 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  39.19 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.68 
 
 
371 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2734  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.91 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.68 
 
 
373 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.68 
 
 
371 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4149  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.68 
 
 
109 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2768  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.47 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>