253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0922 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  100 
 
 
242 aa  497  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0916  cAMP-dependent protein - catabolite gene activator and regulatory subunit  33.33 
 
 
152 aa  85.1  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.38 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8366  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.64 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  31.07 
 
 
111 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  31.13 
 
 
111 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2709  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.68 
 
 
123 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  33.33 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  33.68 
 
 
110 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  36.27 
 
 
111 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1628  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  30.28 
 
 
109 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  44.93 
 
 
116 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.73 
 
 
114 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3081  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.76 
 
 
114 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0978825  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.95 
 
 
120 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31 
 
 
131 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.71 
 
 
286 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.47 
 
 
146 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.33 
 
 
98 aa  60.1  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1079  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29.41 
 
 
110 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0175517  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  27.46 
 
 
164 aa  58.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  30 
 
 
141 aa  58.5  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
228 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  33.65 
 
 
113 aa  58.5  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.14 
 
 
106 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1482  Rieske (2Fe-2S) region  34.74 
 
 
110 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  31.25 
 
 
599 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33 
 
 
112 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29 
 
 
114 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383279  normal  0.78464 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5893  nitrite reductase small subunit  28.28 
 
 
111 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.02 
 
 
112 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4524  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  28.89 
 
 
112 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18750  phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  28.57 
 
 
124 aa  56.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485806  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  34.38 
 
 
119 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28 
 
 
122 aa  55.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5508  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.59 
 
 
104 aa  55.1  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.358971 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  31.37 
 
 
106 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.37 
 
 
106 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0720  Rieske (2Fe-2S) region  29.52 
 
 
109 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.457021  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  31.37 
 
 
106 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  31.37 
 
 
106 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  31.37 
 
 
106 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  31.37 
 
 
106 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  30.21 
 
 
111 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  31.37 
 
 
106 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  31.37 
 
 
106 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  31.37 
 
 
289 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.88 
 
 
123 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1708  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  29.17 
 
 
113 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.78764  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  35.71 
 
 
96 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  31.91 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.67 
 
 
127 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0965  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.84 
 
 
100 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00646524 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.98 
 
 
521 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.33 
 
 
112 aa  53.1  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2967  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  29.7 
 
 
114 aa  52.4  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2444  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.9 
 
 
117 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44307  normal  0.0794581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
226 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2251  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 
104 aa  52  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.322428  normal  0.209318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
285 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  28.87 
 
 
105 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  28.87 
 
 
105 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  28.87 
 
 
105 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  28.57 
 
 
104 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.61 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  28.99 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  29.46 
 
 
167 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  28.57 
 
 
105 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1596  toluene-4-monooxygenase system protein C  34.18 
 
 
117 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1989  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  29.29 
 
 
104 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  37.5 
 
 
108 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0434  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.52 
 
 
105 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2675  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.75 
 
 
506 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148641  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2815  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26 
 
 
107 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717991 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0311  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.28 
 
 
105 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  27.19 
 
 
407 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  28.57 
 
 
105 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0306  cyclic nucleotide-binding protein  22.86 
 
 
166 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2066  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.61 
 
 
121 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.7 
 
 
1016 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6777  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.17 
 
 
103 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.130934 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
114 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41540  assimilatory nitrite reductase small subunit  28.7 
 
 
108 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 
105 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  27.84 
 
 
118 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  27.84 
 
 
118 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  29.82 
 
 
226 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0591  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  27 
 
 
118 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1001  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.37 
 
 
116 aa  49.7  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3526  assimilatory nitrite reductase small subunit  27.78 
 
 
108 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  29.46 
 
 
167 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  27.27 
 
 
109 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  32.5 
 
 
126 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  40 
 
 
102 aa  48.5  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1701  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  28.57 
 
 
132 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104071  normal  0.427616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>