More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3274 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3274  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
105 aa  216  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2246  Rieske (2Fe-2S) domain protein  64.65 
 
 
109 aa  133  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00879762  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  56.25 
 
 
125 aa  123  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  56.99 
 
 
102 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  60.47 
 
 
102 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.47 
 
 
102 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  57.14 
 
 
106 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3052  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  53.68 
 
 
135 aa  104  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279296  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.26 
 
 
100 aa  102  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  56.1 
 
 
96 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1393  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  52 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.72 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3775  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.67 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2967  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  44.44 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476557  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.17 
 
 
107 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.11 
 
 
361 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.11 
 
 
361 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  40.62 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  40.62 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  40.62 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  40.62 
 
 
105 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  40.62 
 
 
105 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  40.62 
 
 
105 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  40.62 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.79 
 
 
361 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2423  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  38.98 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2471  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  38.98 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  39.06 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2151  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  42.37 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.981833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0207  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  39.06 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  36.11 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383279  normal  0.78464 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1911  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.83 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1989  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  38.98 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2964  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  35.64 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1996  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.83 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.664018  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31 
 
 
111 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0965  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.74 
 
 
100 aa  57.4  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00646524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.87 
 
 
504 aa  57  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1967  Rieske (2Fe-2S) region  34.48 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0966264  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1079  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29.79 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0175517  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1628  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  35.71 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  34.04 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29.79 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00226382  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  31.68 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1001  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29.47 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  32.63 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  36 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4524  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.29 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3529  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  40.24 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0955  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.85 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  34.07 
 
 
315 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.65 
 
 
114 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2308  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  42.86 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619497  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  32.94 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5893  nitrite reductase small subunit  32.39 
 
 
111 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.03 
 
 
294 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1708  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  36.11 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.78764  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2955  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  38.03 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1533  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.36 
 
 
383 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.64 
 
 
513 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0173  Rieske (2Fe-2S) region  36.49 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1267  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  35 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2848  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  44.93 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  36.9 
 
 
292 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.93 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  30.21 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.05 
 
 
376 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2679  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  38.36 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  35.11 
 
 
106 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1405  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  33.68 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3123  Rieske (2Fe-2S) protein  30.56 
 
 
349 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.164048 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1113  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29.35 
 
 
120 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.89 
 
 
509 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7057  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.14 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250016  normal  0.403256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.99 
 
 
475 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0591  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34.21 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  37.33 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2594  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.38 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  34.62 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2558  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  46.3 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1987  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0557  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  35.44 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0740  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  35.44 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  31.71 
 
 
111 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2677  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.33 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0572  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  35.44 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237046  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4349  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.87 
 
 
516 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504096  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4231  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.62 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3131  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  35.44 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.98 
 
 
377 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  28.26 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0100  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  35 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0720  Rieske (2Fe-2S) region  34.29 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.457021  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  36.84 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3278  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  36.71 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.08 
 
 
376 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.25 
 
 
385 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2918  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  35 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41540  assimilatory nitrite reductase small subunit  41.27 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2318  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  34.48 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>