More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0648 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  98.61 
 
 
361 aa  733    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
361 aa  741    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  96.4 
 
 
361 aa  719    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  83.7 
 
 
377 aa  625  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  59.94 
 
 
344 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174244  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5800  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.03 
 
 
354 aa  401  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198597 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  41.26 
 
 
353 aa  253  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1676  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.04 
 
 
349 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.945696  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1649  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.04 
 
 
370 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1235  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.81 
 
 
349 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1064  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.29 
 
 
387 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.78 
 
 
349 aa  237  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  34.55 
 
 
362 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  24.86 
 
 
369 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  34.94 
 
 
351 aa  96.7  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  26.59 
 
 
346 aa  96.3  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.93 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.93 
 
 
364 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.55 
 
 
350 aa  95.1  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  26.25 
 
 
380 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  34.34 
 
 
356 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.22 
 
 
367 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  31 
 
 
345 aa  94  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  31.25 
 
 
347 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
358 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.99 
 
 
324 aa  93.2  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  27.6 
 
 
353 aa  93.2  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.08 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  32.73 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.67 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0218  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  23.63 
 
 
444 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.163513  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  32.53 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  35.71 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08501  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  23.34 
 
 
444 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185666 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  32.54 
 
 
350 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  33.53 
 
 
334 aa  89  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.45 
 
 
331 aa  89  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  34.12 
 
 
340 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  33.33 
 
 
342 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3264  vanillate monooxygenase  34.08 
 
 
350 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112363 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.17 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.65 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.98 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.71 
 
 
353 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  27.38 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.39 
 
 
362 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.17 
 
 
362 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  35.33 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  33.93 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  24.01 
 
 
358 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  31.33 
 
 
353 aa  87  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  31.52 
 
 
383 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.12 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  33.73 
 
 
347 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  29.94 
 
 
370 aa  86.3  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  30.72 
 
 
349 aa  86.3  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  26.25 
 
 
492 aa  85.9  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  25.51 
 
 
460 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  25.47 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  27.22 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  29.13 
 
 
431 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  34.55 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.56 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  33.12 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.94 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.37 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  30.65 
 
 
417 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.65 
 
 
324 aa  84  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.89 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  31.79 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3509  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.08 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.89 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  28.89 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  28.99 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.33 
 
 
406 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  32.95 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.4 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  26.49 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4566  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.67 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0832436  normal  0.12498 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  35.12 
 
 
359 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  35.71 
 
 
351 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  28.87 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.94 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  31.71 
 
 
371 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  33.14 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  34.15 
 
 
352 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  26.76 
 
 
452 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  29.94 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.93 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  31.93 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.93 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  29.82 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  33.14 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  27.63 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  33.53 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  33.33 
 
 
452 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  30.3 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>