247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2541 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  100 
 
 
111 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  67.57 
 
 
111 aa  175  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  59.46 
 
 
111 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  60.36 
 
 
111 aa  160  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  59.09 
 
 
116 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  57.27 
 
 
111 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  57.27 
 
 
111 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  37.38 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  40.57 
 
 
126 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 
111 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.81 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1596  toluene-4-monooxygenase system protein C  43.3 
 
 
117 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.27 
 
 
122 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.83 
 
 
103 aa  90.9  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.6 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.61 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  39.81 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  36.89 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.38 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.58 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  34.38 
 
 
96 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2198  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.95 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  36.27 
 
 
242 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  36.36 
 
 
599 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35.29 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2879  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.81 
 
 
107 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.388175  normal  0.0551812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  28.28 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.28 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  30.3 
 
 
270 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1194  biphenyl 2,3-dioxygenase ferredoxin subunit (BphA3)  35.58 
 
 
109 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889683  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.95 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  34.62 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3274  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.94 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.35 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.14 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0965  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.37 
 
 
100 aa  52.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00646524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3775  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.74 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2066  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.19 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1326  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.67 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.710748  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.94 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.53 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1663  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.44 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.29 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
100 aa  52  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.52 
 
 
521 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4149  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  31.82 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.93 
 
 
513 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2338  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.95 
 
 
113 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.700788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.7 
 
 
518 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1457  MocE Rieske (2Fe-2S)  30.53 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2251  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.65 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.322428  normal  0.209318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.85 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.84 
 
 
509 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  32.71 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.93 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  26.58 
 
 
105 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.25 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.23 
 
 
504 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1672  hypothetical protein  31.73 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1393  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.38 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0940  putative Rieske (2Fe-2S) ferredoxin  33.7 
 
 
114 aa  50.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34.38 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.8 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0526  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
321 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
361 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  25 
 
 
105 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3052  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.59 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279296  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  28.28 
 
 
521 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
361 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1970  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.79 
 
 
546 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.91 
 
 
604 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.29 
 
 
361 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5152  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.04 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.5 
 
 
521 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  27.96 
 
 
291 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3081  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.21 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0978825  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14640  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  32.35 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.857724  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2815  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.7 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717991 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  25.32 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  25.32 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  24.76 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4283  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0344911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2246  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.12 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00879762  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2840  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  27.45 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.41626 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1349  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.11 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.203828 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  25.32 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  25.32 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  25.32 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  28.57 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5508  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.43 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  25.32 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2151  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  27.17 
 
 
105 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.981833  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.98 
 
 
285 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>