222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6713 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  100 
 
 
96 aa  200  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.96 
 
 
131 aa  160  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  75 
 
 
112 aa  159  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  67.71 
 
 
112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  41.76 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  41.98 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  37.36 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  40.74 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  37.65 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.25 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  34.38 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.56 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.56 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  37.8 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  36.26 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.96 
 
 
111 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.47 
 
 
509 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4231  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.73 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.14 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  32.89 
 
 
270 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.56 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.56 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  34.83 
 
 
353 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.62 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  35.71 
 
 
242 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4570  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.62 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0919723  hitchhiker  0.000210645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0173  Rieske (2Fe-2S) region  35.62 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3982  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.62 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0367029 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1338  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  34.25 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872244  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2492  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.25 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1503  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  34.25 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  34.15 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0321  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  34.25 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.23021  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0597  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  34.25 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0893389  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1305  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.25 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.935545  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1232  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.25 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0970  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  34.25 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1103  Rieske (2Fe-2S) protein  34.25 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476425  normal  0.326175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0217  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  42.11 
 
 
437 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7057  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.62 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250016  normal  0.403256 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.75 
 
 
101 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.25 
 
 
105 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3656  Rieske (2Fe-2S) region  34.25 
 
 
105 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747877  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4711  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.25 
 
 
105 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938131  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.29 
 
 
521 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  33.77 
 
 
369 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.7 
 
 
127 aa  50.8  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.07 
 
 
361 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 
361 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0207  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  30 
 
 
105 aa  50.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
100 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  29.55 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.55 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  29.55 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  29.55 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  29.55 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  29.55 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  29.55 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  29.55 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  28.75 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0844  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.51 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3350  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.51 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.07 
 
 
361 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  32.88 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.25 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
406 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  33.72 
 
 
521 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0130  Rieske (2Fe-2S) protein  28.38 
 
 
106 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23360  assimilatory nitrite reductase, small subunit  30.12 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0534419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2541  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.63 
 
 
506 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  40 
 
 
345 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1349  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.89 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.203828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.67 
 
 
513 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.04 
 
 
360 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  31.82 
 
 
99 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.17 
 
 
504 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  35.06 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  34.72 
 
 
289 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0795  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.39 
 
 
105 aa  47  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.41 
 
 
99 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.86 
 
 
125 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  30.77 
 
 
383 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3175  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.62 
 
 
506 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759164  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  26.74 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  30.26 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.33 
 
 
309 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  31.08 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  26.74 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.57 
 
 
406 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  26.83 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.35 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2675  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.63 
 
 
506 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148641  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.25 
 
 
352 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  34.67 
 
 
291 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  31.4 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.58 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4721  Rieske (2Fe-2S) region  28.95 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.66 
 
 
357 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.28 
 
 
370 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>