146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1596 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1596  toluene-4-monooxygenase system protein C  100 
 
 
117 aa  241  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  48.7 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  51.52 
 
 
116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  47.42 
 
 
111 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.49 
 
 
111 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.49 
 
 
111 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  47.42 
 
 
111 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  40 
 
 
111 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  43.3 
 
 
111 aa  94.4  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2198  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.65 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.29 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  37.5 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  36.19 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.85 
 
 
475 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35.64 
 
 
111 aa  53.9  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  28 
 
 
270 aa  53.9  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.17 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  33.33 
 
 
599 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  34.18 
 
 
242 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  28.87 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4762  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.03 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.22 
 
 
301 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  32.22 
 
 
296 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2879  nitrite reductase (NAD(P)H)subunit  37.04 
 
 
971 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.68 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  29.35 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  32.69 
 
 
382 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
112 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.48 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1393  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.05 
 
 
117 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  31.65 
 
 
151 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26 
 
 
309 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.96 
 
 
497 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0977  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.35 
 
 
212 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  32.71 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  31.17 
 
 
492 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.43 
 
 
376 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.1 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2249  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.74 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.96 
 
 
497 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  30.21 
 
 
289 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0994  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.5 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14640  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  32.67 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.857724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
374 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
374 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
374 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6323  Rieske (2Fe-2S) region  31.63 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  44.19 
 
 
442 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3274  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.29 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.47 
 
 
447 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4719  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.69 
 
 
447 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.94 
 
 
374 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3775  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.03 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6777  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.37 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.130934 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2383  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.33 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.270871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  30.59 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2693  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.79 
 
 
506 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563055  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  31.94 
 
 
374 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.94 
 
 
374 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  31.94 
 
 
374 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.94 
 
 
374 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.94 
 
 
374 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.62 
 
 
373 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.94 
 
 
374 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  31.94 
 
 
374 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01974  benzene 1,2-dioxygenase ferredoxin protein  32.99 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0274053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  31.94 
 
 
374 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  32.65 
 
 
499 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1457  MocE Rieske (2Fe-2S)  31.68 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2455  Rieske (2Fe-2S) protein  30.77 
 
 
388 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1708  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  29.11 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.78764  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.27 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2246  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.89 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00879762  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.82 
 
 
352 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  29.55 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.81 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  32.93 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13360  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  31.96 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.823074  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  28.12 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0589  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.77 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.14 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.12 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.56 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7184  Rieske (2Fe-2S) domain protein, MocE subfamily  31.68 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00608599  normal  0.029061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3110  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.99 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912121  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  29.73 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.29 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  35.21 
 
 
289 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4570  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.14 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0919723  hitchhiker  0.000210645 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  29.73 
 
 
105 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.7 
 
 
105 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5006  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.71 
 
 
105 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0704074  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0406  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.93 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.79 
 
 
361 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>