More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1056 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  66.26 
 
 
497 aa  708    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
499 aa  1045    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  66.39 
 
 
497 aa  704    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  40.91 
 
 
668 aa  383  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  34.81 
 
 
442 aa  247  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  35.26 
 
 
492 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0964  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.41 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  35.32 
 
 
443 aa  243  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3116  Pheophorbide a oxygenase  34.66 
 
 
442 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3793  pheophorbide a oxygenase  33.92 
 
 
443 aa  236  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  34.4 
 
 
461 aa  230  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  34.15 
 
 
460 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2189  Pheophorbide a oxygenase  32.54 
 
 
474 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  33.33 
 
 
465 aa  220  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  33.56 
 
 
498 aa  220  6e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  35.57 
 
 
477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  37.03 
 
 
456 aa  213  7e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  35.52 
 
 
438 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40637  predicted protein  33.7 
 
 
510 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.55 
 
 
450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.64 
 
 
450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  31.89 
 
 
353 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.48 
 
 
373 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.99 
 
 
331 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.67 
 
 
327 aa  90.5  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2105  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  42.62 
 
 
332 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.886658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2050  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  42.62 
 
 
332 aa  90.1  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2244  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.62 
 
 
332 aa  90.1  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.937061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2331  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.33 
 
 
326 aa  89.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.83 
 
 
338 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.49 
 
 
330 aa  87.8  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  39.5 
 
 
438 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  30.58 
 
 
353 aa  87.4  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  32.22 
 
 
345 aa  87  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.26 
 
 
345 aa  86.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  38.14 
 
 
452 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1064  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.41 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.69 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3154  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.67 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.647374  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  32.04 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  41.58 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  42.57 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  37.82 
 
 
452 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  31.11 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  38.71 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.97 
 
 
337 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.84 
 
 
448 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  35.29 
 
 
452 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.62 
 
 
372 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  29.38 
 
 
342 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.18 
 
 
315 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.51 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  38.02 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1818  putative Rieske iron-sulfur protein  39.84 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0390  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39.84 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.84 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0488  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39.84 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.386184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.38 
 
 
449 aa  81.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.86 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0622  putative Rieske (2Fe-2S) protein  35.81 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0948094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.76 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.59 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.72 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  32.78 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.14 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.14 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  31.33 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.82 
 
 
347 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.02 
 
 
330 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.169671  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  30.93 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.57 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.57 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2122  putative iron-sulphur protein  39.02 
 
 
330 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  29.85 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  36.36 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.63 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.25 
 
 
349 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  36.51 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.18 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.22 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  28.32 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  36.28 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  28.83 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  29.12 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  30.11 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  28.9 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  30.05 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  30.52 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  30.29 
 
 
347 aa  77  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  33.53 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  27.81 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2482  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.76 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  29.34 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  30 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  30.17 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.54 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.92 
 
 
363 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.54 
 
 
324 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.07 
 
 
353 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>