More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3574 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
349 aa  725    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  70.11 
 
 
347 aa  525  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  65.78 
 
 
349 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  63.69 
 
 
362 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  62.82 
 
 
362 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.53 
 
 
367 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  30.36 
 
 
369 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2482  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.38 
 
 
362 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  34.87 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.05 
 
 
362 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  37.82 
 
 
334 aa  133  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1459  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.11 
 
 
357 aa  126  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0280358  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.64 
 
 
371 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  35.64 
 
 
371 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.64 
 
 
371 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.15 
 
 
370 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  36.41 
 
 
371 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.15 
 
 
373 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.15 
 
 
373 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.08 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.54 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  27.54 
 
 
352 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.86 
 
 
360 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  32.99 
 
 
383 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.39 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.51 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  38.99 
 
 
369 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  32.8 
 
 
359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  34.12 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.58 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.46 
 
 
450 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.46 
 
 
450 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  36.02 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  37.11 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  37.74 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.36 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  34.36 
 
 
338 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.49 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.49 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.14 
 
 
355 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  34.73 
 
 
367 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.4 
 
 
355 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  26.78 
 
 
355 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.4 
 
 
355 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.4 
 
 
355 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.4 
 
 
355 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  31.21 
 
 
362 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.65 
 
 
352 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.4 
 
 
355 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.4 
 
 
355 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.4 
 
 
355 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  25.71 
 
 
358 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  36.02 
 
 
373 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.36 
 
 
353 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  37.27 
 
 
359 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.44 
 
 
349 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  36.31 
 
 
363 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  37.89 
 
 
353 aa  106  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  23.91 
 
 
377 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.43 
 
 
363 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  38.75 
 
 
342 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.17 
 
 
343 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.71 
 
 
356 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  25.71 
 
 
356 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  36.65 
 
 
373 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.29 
 
 
356 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  35.54 
 
 
492 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.5 
 
 
356 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.07 
 
 
356 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.65 
 
 
359 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  36.65 
 
 
359 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.65 
 
 
359 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  25.38 
 
 
343 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  32.33 
 
 
351 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  27.3 
 
 
347 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.07 
 
 
356 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  36.36 
 
 
347 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  34.57 
 
 
359 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  35.67 
 
 
356 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.42 
 
 
362 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.6 
 
 
321 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.6 
 
 
324 aa  103  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  37.97 
 
 
351 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  33.54 
 
 
423 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  37.97 
 
 
351 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.77 
 
 
424 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  27.62 
 
 
347 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3160  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.98 
 
 
347 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.57 
 
 
364 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  26.8 
 
 
351 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.8 
 
 
354 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  36.48 
 
 
349 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.44 
 
 
331 aa  99.8  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  32.74 
 
 
353 aa  99.8  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  33.54 
 
 
347 aa  99.8  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.4 
 
 
347 aa  99.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.54 
 
 
351 aa  99.4  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  29.01 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  32.74 
 
 
349 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>