More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2725 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
354 aa  742    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  82.86 
 
 
351 aa  620  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  80.12 
 
 
355 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  80 
 
 
352 aa  590  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  77.05 
 
 
355 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  78.72 
 
 
359 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  78.72 
 
 
359 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  79.01 
 
 
373 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  78.72 
 
 
359 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  76.77 
 
 
355 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  78.13 
 
 
359 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  78.36 
 
 
355 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  75.07 
 
 
353 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  76.81 
 
 
373 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  75.07 
 
 
354 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  78.4 
 
 
363 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  74.22 
 
 
354 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  74.49 
 
 
351 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  76.25 
 
 
342 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  73.91 
 
 
351 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.11 
 
 
367 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.89 
 
 
343 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.89 
 
 
347 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.57 
 
 
351 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  66.76 
 
 
349 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  42.57 
 
 
369 aa  292  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  44.83 
 
 
347 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  43.82 
 
 
347 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  45.32 
 
 
347 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  40.86 
 
 
350 aa  285  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  40.62 
 
 
377 aa  272  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  39.65 
 
 
352 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.55 
 
 
361 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  38.29 
 
 
424 aa  262  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.86 
 
 
353 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  36.42 
 
 
338 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  35.33 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  33.91 
 
 
353 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  33.14 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.99 
 
 
353 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  32.74 
 
 
358 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  34.69 
 
 
350 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  34.57 
 
 
336 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.29 
 
 
345 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  36.29 
 
 
351 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  33.53 
 
 
340 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.82 
 
 
358 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  33.62 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  33.24 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  32.01 
 
 
366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  31.41 
 
 
370 aa  179  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  31.73 
 
 
347 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  30.61 
 
 
367 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.05 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  33.43 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  32.04 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  33.43 
 
 
350 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  29.34 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  31.61 
 
 
370 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  31.69 
 
 
362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  31.23 
 
 
363 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  32.24 
 
 
359 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  32.3 
 
 
348 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  30.28 
 
 
350 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  30.92 
 
 
358 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.07 
 
 
350 aa  155  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.4 
 
 
357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  29.89 
 
 
356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  30.84 
 
 
345 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  28.7 
 
 
347 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  31 
 
 
361 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  30.36 
 
 
347 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  31.11 
 
 
359 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.49 
 
 
353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.15 
 
 
367 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  30.37 
 
 
423 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.37 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0852  Rieske (2Fe-2S) region  29.02 
 
 
355 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  30.06 
 
 
353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.06 
 
 
362 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  29.55 
 
 
349 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3264  vanillate monooxygenase  29.51 
 
 
350 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112363 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  29.79 
 
 
345 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1542  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.81 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0106115  decreased coverage  0.000412121 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  29.2 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  27.51 
 
 
357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  27.01 
 
 
349 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  30.25 
 
 
407 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.26 
 
 
357 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.95 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  28.41 
 
 
351 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.37 
 
 
364 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  36.69 
 
 
334 aa  119  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.37 
 
 
355 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.21 
 
 
356 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.79 
 
 
356 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.37 
 
 
355 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.37 
 
 
355 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.37 
 
 
355 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.21 
 
 
356 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>