More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1137 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  100 
 
 
350 aa  727    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  74.85 
 
 
347 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  73.99 
 
 
347 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  73.7 
 
 
347 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  66.76 
 
 
369 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  63.25 
 
 
352 aa  491  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  63.16 
 
 
424 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  60.52 
 
 
361 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  57.47 
 
 
377 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.88 
 
 
359 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.88 
 
 
359 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  45.88 
 
 
359 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  45.19 
 
 
353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.19 
 
 
352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  44.71 
 
 
359 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  44.02 
 
 
373 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.71 
 
 
343 aa  300  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  45.45 
 
 
351 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  41.76 
 
 
351 aa  296  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.44 
 
 
355 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.15 
 
 
355 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.44 
 
 
355 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  44.57 
 
 
351 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  43.11 
 
 
373 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.86 
 
 
355 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.12 
 
 
347 aa  292  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  42.49 
 
 
354 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  43.4 
 
 
354 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  41.33 
 
 
349 aa  289  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  41.47 
 
 
342 aa  289  6e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  42.73 
 
 
350 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  43.27 
 
 
363 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.37 
 
 
353 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.16 
 
 
367 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41 
 
 
354 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.73 
 
 
351 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  39.13 
 
 
355 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  36.02 
 
 
346 aa  236  4e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  36.5 
 
 
336 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.58 
 
 
358 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.35 
 
 
353 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  36.55 
 
 
340 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  36.2 
 
 
345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  35.86 
 
 
358 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  37.06 
 
 
353 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  37.28 
 
 
352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.93 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  35.09 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  36.84 
 
 
367 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  37.54 
 
 
350 aa  206  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  34.78 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  33.72 
 
 
370 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  36.28 
 
 
338 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  34.57 
 
 
366 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  34.2 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  33.72 
 
 
363 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  36.73 
 
 
347 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  35.58 
 
 
359 aa  192  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.12 
 
 
350 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  35 
 
 
351 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  34.49 
 
 
342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  33.15 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  34.1 
 
 
345 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  32.28 
 
 
356 aa  182  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  34.44 
 
 
361 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  31.87 
 
 
359 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  33.52 
 
 
366 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  34.6 
 
 
362 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  33.99 
 
 
350 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  28.91 
 
 
370 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.63 
 
 
367 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  33.52 
 
 
347 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  35.98 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  31.43 
 
 
357 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  33.53 
 
 
423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  33.52 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.38 
 
 
365 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  35.88 
 
 
341 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0852  Rieske (2Fe-2S) region  31.99 
 
 
355 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  29.26 
 
 
349 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.7 
 
 
357 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.67 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  31.44 
 
 
353 aa  155  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.49 
 
 
353 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  31.81 
 
 
356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.36 
 
 
357 aa  149  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  31.71 
 
 
349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  29.92 
 
 
407 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3264  vanillate monooxygenase  27.47 
 
 
350 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.03 
 
 
353 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1542  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.94 
 
 
366 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0106115  decreased coverage  0.000412121 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  26.67 
 
 
334 aa  113  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  26.73 
 
 
345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  37.11 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1459  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.58 
 
 
357 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0280358  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.36 
 
 
406 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.13 
 
 
360 aa  105  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.13 
 
 
406 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  31.87 
 
 
380 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.15 
 
 
371 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>