More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1355 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 358 aa  739    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.09 
 
 		 353 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  70.5 
 
 		 352 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  69.32 
 
 		 353 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  64.81 
 
 		 358 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  43.36 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.83 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  36.57 
 
 		 350 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  36.71 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  37.72 
 
 		 350 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  36.13 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  37.07 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.31 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  37.36 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  36.34 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  34.82 
 
 		 369 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  39.41 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.07 
 
 		 347 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  36.31 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  37.25 
 
 		 342 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  36.06 
 
 		 349 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.43 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.11 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  37.13 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.13 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  36.81 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  36.87 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.29 
 
 		 343 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  34.2 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  34.9 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  36.36 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.49 
 
 		 424 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.82 
 
 		 354 aa  186  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.09 
 
 		 341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  36.21 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.81 
 
 		 355 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  34.1 
 
 		 346 aa  182  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.82 
 
 		 352 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  36.08 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.37 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  34.1 
 
 		 354 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  34.31 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.72 
 
 		 355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  33.43 
 
 		 340 aa  172  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.72 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.01 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  33.82 
 
 		 354 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  32.75 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  33.43 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  34.42 
 
 		 361 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  32.42 
 
 		 350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  32.48 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.28 
 
 		 365 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  35.57 
 
 		 345 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  35.46 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  35.37 
 
 		 359 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  34.18 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  33.14 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  32.55 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  32.12 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  31.38 
 
 		 367 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  34.21 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  33.61 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  34.91 
 
 		 347 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  33.33 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  31.2 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.39 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  30.75 
 
 		 370 aa  146  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.83 
 
 		 357 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0852  Rieske (2Fe-2S) region  33.21 
 
 		 355 aa  145  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  32.85 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  32.46 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  32.27 
 
 		 362 aa  142  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.7 
 
 		 353 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.11 
 
 		 357 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  32.38 
 
 		 356 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  29.59 
 
 		 359 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  32.95 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  29.85 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  29.45 
 
 		 357 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  31.05 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  30.64 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.54 
 
 		 353 aa  133  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  33.54 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  31.12 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1542  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.41 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0106115  decreased coverage  0.000412121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3264  vanillate monooxygenase  28.78 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  34.15 
 
 		 407 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.7 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  31.3 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.87 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  30.99 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  29.78 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.22 
 
 		 374 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.77 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.67 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.67 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.81 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.75 
 
 		 358 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>