More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4769 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  100 
 
 		 367 aa  754    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  44.8 
 
 		 358 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  45.77 
 
 		 382 aa  275  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.91 
 
 		 373 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.23 
 
 		 358 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  32.68 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  33.08 
 
 		 345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  31.21 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  36.68 
 
 		 345 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  35.35 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.06 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  31.72 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  36.92 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  30.6 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  37.1 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.41 
 
 		 367 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.64 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.21 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  30.86 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  24.39 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.38 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  28.75 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.36 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.74 
 
 		 354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.51 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  36.7 
 
 		 377 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  34.36 
 
 		 352 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.66 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  34.72 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.87 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.55 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  43.2 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.42 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.31 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  34.43 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.08 
 
 		 349 aa  110  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  35.42 
 
 		 359 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.42 
 
 		 359 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  38.32 
 
 		 342 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  34.54 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.64 
 
 		 337 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  35.76 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.3 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  37.8 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.11 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1235  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.38 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.7 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  38.27 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  33.33 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  36.26 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 		 357 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  30.6 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  32.7 
 
 		 347 aa  106  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.65 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.44 
 
 		 343 aa  106  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1064  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.33 
 
 		 387 aa  106  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  31.22 
 
 		 370 aa  105  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  28.28 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  35.76 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  31.63 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  30.53 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.65 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.91 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.3 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  30.54 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  29.39 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.59 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  30.88 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  31.61 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  32.98 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  39.02 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.72 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  34.88 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  30.29 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  33.94 
 
 		 342 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.32 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  37.35 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  35.05 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.37 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1649  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.53 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1676  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.53 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.945696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.69 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  34.73 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.05 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.85 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  32.47 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.5 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.8 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  34.36 
 
 		 351 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.06 
 
 		 362 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.59 
 
 		 388 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  33.9 
 
 		 345 aa  99.4  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  32.56 
 
 		 356 aa  99.4  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  30.6 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  35.8 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 370 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  37.87 
 
 		 362 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  27.09 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>