More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1485 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
343 aa  714    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  75.59 
 
 
351 aa  539  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  73.82 
 
 
351 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.29 
 
 
354 aa  531  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  74.12 
 
 
355 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  74.12 
 
 
355 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  73.53 
 
 
355 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  74.41 
 
 
359 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.24 
 
 
355 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  70.88 
 
 
352 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.59 
 
 
359 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  72.35 
 
 
353 aa  519  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.3 
 
 
359 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  72.3 
 
 
359 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  73.24 
 
 
373 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  72.65 
 
 
373 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  72.06 
 
 
351 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  70.29 
 
 
354 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  71.18 
 
 
351 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  71.18 
 
 
342 aa  495  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  68.22 
 
 
367 aa  491  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  69.12 
 
 
354 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  70 
 
 
363 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.39 
 
 
347 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  64.31 
 
 
349 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  46.47 
 
 
347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  45.16 
 
 
377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  47.94 
 
 
347 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  47.35 
 
 
347 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  44.71 
 
 
350 aa  300  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  45.45 
 
 
369 aa  299  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  43.77 
 
 
424 aa  299  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  42.94 
 
 
352 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.38 
 
 
361 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  37.32 
 
 
350 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  37.5 
 
 
338 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.72 
 
 
353 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  38.01 
 
 
351 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.06 
 
 
353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  35.57 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  35.96 
 
 
353 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  32.65 
 
 
346 aa  190  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  33.24 
 
 
358 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.44 
 
 
358 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  36.15 
 
 
347 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  33.72 
 
 
336 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  33.33 
 
 
367 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  33.24 
 
 
355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  32.85 
 
 
347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  33.62 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.72 
 
 
341 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  31.98 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.41 
 
 
345 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  34.43 
 
 
359 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  33.14 
 
 
350 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  31.51 
 
 
358 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  32.36 
 
 
366 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  33.05 
 
 
350 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  32.37 
 
 
345 aa  166  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  32.55 
 
 
362 aa  165  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  30.32 
 
 
347 aa  165  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  30.14 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  30.72 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  30.31 
 
 
353 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  29.6 
 
 
366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.62 
 
 
350 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  30.84 
 
 
370 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  33.05 
 
 
423 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.49 
 
 
357 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  29.39 
 
 
356 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.9 
 
 
353 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  31.01 
 
 
359 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  30.11 
 
 
349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.27 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  29.43 
 
 
361 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  30.59 
 
 
347 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  30.25 
 
 
353 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.59 
 
 
367 aa  142  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3264  vanillate monooxygenase  30.09 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  30.03 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  29.86 
 
 
351 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  31.81 
 
 
341 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  28.99 
 
 
357 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.83 
 
 
357 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0852  Rieske (2Fe-2S) region  27.71 
 
 
355 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  29.58 
 
 
349 aa  133  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.37 
 
 
362 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1542  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.53 
 
 
366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0106115  decreased coverage  0.000412121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  30.75 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  28.61 
 
 
356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.78 
 
 
353 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  26.95 
 
 
334 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.2 
 
 
364 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.27 
 
 
315 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3681  Rieske (2Fe-2S) region  35.5 
 
 
346 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.44 
 
 
367 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  27.17 
 
 
349 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.63 
 
 
363 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  33.53 
 
 
345 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  27.22 
 
 
347 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>