More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2826 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  100 
 
 		 424 aa  877    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  65.31 
 
 		 377 aa  475  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  64.91 
 
 		 347 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  63.16 
 
 		 350 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  60.8 
 
 		 369 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  64.33 
 
 		 347 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  62.75 
 
 		 347 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  55.65 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  53.85 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.77 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.23 
 
 		 352 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  41.86 
 
 		 359 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  40.76 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.69 
 
 		 359 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  42.4 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.4 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  41.94 
 
 		 351 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  39.88 
 
 		 351 aa  276  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  40.41 
 
 		 373 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  41.45 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  41.35 
 
 		 351 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.94 
 
 		 347 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.59 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.12 
 
 		 367 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.88 
 
 		 355 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  39.88 
 
 		 342 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39 
 
 		 355 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39 
 
 		 355 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  39.71 
 
 		 354 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  40.23 
 
 		 363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  39.44 
 
 		 350 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.05 
 
 		 354 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  37.93 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.26 
 
 		 353 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  39.41 
 
 		 354 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.81 
 
 		 351 aa  253  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  39.3 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  34.87 
 
 		 346 aa  216  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.82 
 
 		 341 aa  207  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  36.89 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  34.21 
 
 		 336 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  36.15 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.39 
 
 		 345 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  35.78 
 
 		 338 aa  186  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  38.01 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.5 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  35.77 
 
 		 350 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  32.42 
 
 		 358 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.17 
 
 		 353 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  33.06 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  34.87 
 
 		 352 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  34.21 
 
 		 353 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  34.19 
 
 		 359 aa  176  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  33.14 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  33.92 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  33.24 
 
 		 342 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.14 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  32.6 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  30.92 
 
 		 363 aa  170  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  33.33 
 
 		 347 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  36.09 
 
 		 351 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  32.13 
 
 		 353 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  32.09 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  28.81 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  33.14 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  31.32 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  31.79 
 
 		 351 aa  162  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  31.96 
 
 		 345 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  33.7 
 
 		 359 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  30.37 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.49 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  34.18 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  32.67 
 
 		 348 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  31.27 
 
 		 353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.18 
 
 		 353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  34.57 
 
 		 347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  31.62 
 
 		 356 aa  147  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3264  vanillate monooxygenase  30.87 
 
 		 350 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.4 
 
 		 357 aa  146  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.38 
 
 		 365 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  31.35 
 
 		 350 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  29.3 
 
 		 361 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1542  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 		 366 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0106115  decreased coverage  0.000412121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.72 
 
 		 362 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.58 
 
 		 353 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  27.22 
 
 		 357 aa  136  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  28.69 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0852  Rieske (2Fe-2S) region  26.13 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  30.23 
 
 		 349 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  31.56 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.41 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  34.97 
 
 		 380 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.8 
 
 		 406 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  32.77 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1459  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 		 357 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0280358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.16 
 
 		 360 aa  96.3  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  33.53 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  34.71 
 
 		 345 aa  94.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  32.95 
 
 		 366 aa  94  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>