More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2184 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  100 
 
 		 347 aa  723    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  85.8 
 
 		 347 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  84.64 
 
 		 347 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  74.85 
 
 		 350 aa  560  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  70.52 
 
 		 369 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  63.74 
 
 		 352 aa  484  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  63.95 
 
 		 361 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  64.91 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  61.7 
 
 		 377 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.51 
 
 		 359 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.94 
 
 		 347 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  46.47 
 
 		 351 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  47.21 
 
 		 359 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.21 
 
 		 359 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.29 
 
 		 352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  45.88 
 
 		 359 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  46.2 
 
 		 373 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.47 
 
 		 343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  45.45 
 
 		 353 aa  301  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  46.04 
 
 		 342 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.59 
 
 		 355 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  44.71 
 
 		 373 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.71 
 
 		 355 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.71 
 
 		 355 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.71 
 
 		 355 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.38 
 
 		 367 aa  291  9e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  41.94 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  46.26 
 
 		 351 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  45.98 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  45.56 
 
 		 350 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.62 
 
 		 354 aa  286  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  44.9 
 
 		 363 aa  285  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  44.71 
 
 		 354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  43.66 
 
 		 354 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45 
 
 		 351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.34 
 
 		 353 aa  271  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  37.72 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  38.71 
 
 		 355 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  37.69 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  39.3 
 
 		 340 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.72 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  36.09 
 
 		 358 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  36.44 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  36.47 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 		 353 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  38.6 
 
 		 367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.78 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  36.18 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  36.28 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  37.87 
 
 		 338 aa  208  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  38.26 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  36.71 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  34.6 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  37.54 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  34.45 
 
 		 349 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  33.82 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  35.03 
 
 		 366 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  36.63 
 
 		 347 aa  192  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  34.96 
 
 		 358 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  35.34 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  35.58 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  31.49 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  34.48 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  35.15 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  36.07 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  34.75 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  35.34 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  31.53 
 
 		 366 aa  179  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  31.58 
 
 		 370 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  31.84 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 		 357 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  36.29 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  34.57 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0852  Rieske (2Fe-2S) region  34.01 
 
 		 355 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  33.76 
 
 		 423 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.14 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  32.97 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  32.86 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  35.5 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.56 
 
 		 365 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.85 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.36 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  33.05 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  34.2 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3264  vanillate monooxygenase  29.17 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.23 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1542  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.33 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0106115  decreased coverage  0.000412121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.85 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  33.23 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  30.23 
 
 		 407 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.49 
 
 		 357 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  29.67 
 
 		 345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  37.74 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1459  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.42 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0280358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.12 
 
 		 358 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.58 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  34.44 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  26.73 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  36.59 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.58 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.547393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>