More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26080 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  100 
 
 		 377 aa  786    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  63.84 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  61.7 
 
 		 347 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  63.35 
 
 		 347 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  58.94 
 
 		 369 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  63.16 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  57.47 
 
 		 350 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  56.45 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  55.27 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.31 
 
 		 352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.16 
 
 		 343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.16 
 
 		 347 aa  298  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  43.7 
 
 		 342 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  42.82 
 
 		 351 aa  293  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  42.98 
 
 		 353 aa  293  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  43.4 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.57 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  42.69 
 
 		 349 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.57 
 
 		 359 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  43.57 
 
 		 359 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  42.11 
 
 		 350 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  41.91 
 
 		 373 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  41.71 
 
 		 373 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.94 
 
 		 367 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  43.1 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.06 
 
 		 353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  42.12 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.16 
 
 		 355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.83 
 
 		 354 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.29 
 
 		 355 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.29 
 
 		 355 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.29 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.95 
 
 		 351 aa  267  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  40.47 
 
 		 354 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  40.76 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  39.88 
 
 		 354 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  37.39 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  38.44 
 
 		 355 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  35.9 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  37.28 
 
 		 367 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  35.48 
 
 		 336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.03 
 
 		 358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  37.68 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.88 
 
 		 341 aa  212  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.13 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  37.13 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  36.42 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  36.99 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  37.75 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  35.04 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  36.9 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  32.42 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  32.56 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  34.57 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  32.95 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  33.43 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  35.53 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  32.56 
 
 		 363 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  36.44 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  34.93 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  35.34 
 
 		 362 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  32.58 
 
 		 345 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.81 
 
 		 350 aa  178  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  33.14 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  34.01 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  33.63 
 
 		 350 aa  176  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  30.09 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  31.25 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  30.98 
 
 		 349 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  33.88 
 
 		 359 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  31.11 
 
 		 356 aa  169  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  32.34 
 
 		 361 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  34.29 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1542  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.45 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0106115  decreased coverage  0.000412121 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  31.83 
 
 		 358 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.39 
 
 		 357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.01 
 
 		 357 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  33.54 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  29.63 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  31.09 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  33.71 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.85 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  31.16 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  30.12 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.05 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  31.79 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0852  Rieske (2Fe-2S) region  29.77 
 
 		 355 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.74 
 
 		 367 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.39 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3264  vanillate monooxygenase  27.38 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.09 
 
 		 362 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.4 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.4 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  28.4 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  39.41 
 
 		 345 aa  123  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1459  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.81 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0280358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.2 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.7 
 
 		 367 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>