More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1487 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  100 
 
 		 356 aa  748    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  70.33 
 
 		 353 aa  517  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  66.57 
 
 		 349 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  65.19 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  38.48 
 
 		 342 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  37.54 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  41.79 
 
 		 423 aa  245  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  35.82 
 
 		 345 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  36.34 
 
 		 366 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  35.12 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  38.05 
 
 		 367 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  36.66 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  36.44 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  35.48 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  33.89 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  34.31 
 
 		 350 aa  203  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  35.99 
 
 		 341 aa  203  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  34.3 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  35.83 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  32.67 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  33.72 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  31.23 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  31.3 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  32.46 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.26 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  34.58 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.17 
 
 		 353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  34.2 
 
 		 347 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  30.06 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  33.33 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  32.65 
 
 		 347 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  31.52 
 
 		 350 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  29.67 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.83 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.34 
 
 		 361 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  31.11 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.67 
 
 		 424 aa  152  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  30.53 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  30.17 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  38.05 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.05 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  30.7 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  29.64 
 
 		 357 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  31.05 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.05 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 		 359 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  30.39 
 
 		 373 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.97 
 
 		 357 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.69 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  31.11 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  30.49 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.27 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  29.71 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3264  vanillate monooxygenase  30.35 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  29.72 
 
 		 361 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  41.28 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  26.8 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1542  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.14 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0106115  decreased coverage  0.000412121 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.38 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.9 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  30.06 
 
 		 353 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.75 
 
 		 367 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  29.36 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  28.37 
 
 		 366 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0852  Rieske (2Fe-2S) region  31.65 
 
 		 355 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  37.19 
 
 		 351 aa  129  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.38 
 
 		 351 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  28.45 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.51 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  29.66 
 
 		 370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.73 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.75 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.65 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.35 
 
 		 365 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  28.05 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  28.77 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  27.67 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  28.45 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.42 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.49 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  39.66 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.42 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  28.7 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  25.85 
 
 		 370 aa  119  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  27.17 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  29.58 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.95 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.25 
 
 		 351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.91 
 
 		 362 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.39 
 
 		 353 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  35.67 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.73 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.89 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.15 
 
 		 362 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  34.13 
 
 		 407 aa  96.7  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.41 
 
 		 338 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.48 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.15 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.72 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  33.92 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>