More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3214 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 347 aa  718    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  82.4 
 
 		 342 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  75.29 
 
 		 353 aa  541  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  74.56 
 
 		 355 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  75.29 
 
 		 359 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  75.29 
 
 		 359 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  75.29 
 
 		 359 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  74.85 
 
 		 355 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  74.85 
 
 		 355 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  74.13 
 
 		 359 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  74.41 
 
 		 352 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  73.55 
 
 		 351 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  73.55 
 
 		 373 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.1 
 
 		 355 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  73.26 
 
 		 351 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  72.38 
 
 		 373 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.29 
 
 		 354 aa  517  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  72.22 
 
 		 354 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  72.51 
 
 		 354 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  72.09 
 
 		 351 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  70.26 
 
 		 367 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  68.53 
 
 		 349 aa  502  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.97 
 
 		 351 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.39 
 
 		 343 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  68.53 
 
 		 363 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  49.54 
 
 		 347 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  47.94 
 
 		 347 aa  312  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  48.92 
 
 		 347 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  45.14 
 
 		 369 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  45.16 
 
 		 377 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  44.12 
 
 		 350 aa  292  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  43.82 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.19 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.94 
 
 		 424 aa  272  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.6 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  38.84 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  38.33 
 
 		 353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  36.63 
 
 		 350 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  35.92 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  38.79 
 
 		 351 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.07 
 
 		 358 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  36.31 
 
 		 340 aa  202  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  35.14 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  35.4 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 		 353 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  35.45 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  35.57 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  35.16 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  34.29 
 
 		 346 aa  192  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  35.55 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  35.82 
 
 		 342 aa  185  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  35.26 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.95 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  35.24 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  30.82 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  32.1 
 
 		 366 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.57 
 
 		 350 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  32.21 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  30.77 
 
 		 347 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 		 355 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  32.75 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  32.85 
 
 		 356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  33.88 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  31.84 
 
 		 353 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  30.47 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  32.39 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  32.46 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  32.52 
 
 		 361 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.01 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3264  vanillate monooxygenase  32.46 
 
 		 350 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  32.75 
 
 		 362 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  34.19 
 
 		 423 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.14 
 
 		 367 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  33.14 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.48 
 
 		 353 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  32.62 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  30.23 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  28.53 
 
 		 357 aa  143  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  30.64 
 
 		 347 aa  142  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  30.64 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  31.65 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.28 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  31.98 
 
 		 345 aa  136  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  32.29 
 
 		 341 aa  136  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.81 
 
 		 353 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  29.38 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0852  Rieske (2Fe-2S) region  28.53 
 
 		 355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.97 
 
 		 357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  29.89 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1542  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.05 
 
 		 366 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0106115  decreased coverage  0.000412121 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  34.91 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.21 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  29.44 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  37.57 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  31.19 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  27.22 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3967  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.63 
 
 		 347 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>