More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3967 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3967  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 347 aa  728    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  72.07 
 
 		 343 aa  539  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.54 
 
 		 362 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.71 
 
 		 363 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.01 
 
 		 356 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  63.39 
 
 		 355 aa  475  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  62.87 
 
 		 364 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  63.93 
 
 		 356 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.93 
 
 		 356 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.93 
 
 		 356 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  62.61 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  62.61 
 
 		 355 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  62.61 
 
 		 355 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  62.61 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  62.61 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  63.27 
 
 		 358 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  62.61 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  62.61 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.94 
 
 		 356 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.42 
 
 		 356 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  62.57 
 
 		 355 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  63.14 
 
 		 355 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  63.14 
 
 		 355 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3681  Rieske (2Fe-2S) region  53.99 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3160  Rieske (2Fe-2S) domain protein  53.64 
 
 		 347 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0964  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  55.42 
 
 		 341 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.7 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.96 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  29.33 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  33.69 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  28.95 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.63 
 
 		 347 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.48 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  27.67 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.46 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  34.86 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.9 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  32.09 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.86 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.29 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.87 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.68 
 
 		 354 aa  99.4  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.88 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  36.9 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  32.79 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  33.14 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  24.22 
 
 		 349 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  31.82 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  32.18 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  32.39 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  32.37 
 
 		 354 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.65 
 
 		 326 aa  96.7  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  32.2 
 
 		 353 aa  95.9  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.47 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.71 
 
 		 344 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.95 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.09 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  31.79 
 
 		 349 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.46 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.96 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.66 
 
 		 355 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  37.43 
 
 		 347 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.94 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.13 
 
 		 362 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.09 
 
 		 355 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.52 
 
 		 358 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3225  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.34 
 
 		 412 aa  93.6  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0731874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.52 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  32.95 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.94 
 
 		 372 aa  92.8  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.53 
 
 		 355 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  25.84 
 
 		 454 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.72 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.43 
 
 		 362 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  26.52 
 
 		 417 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.11 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  30.05 
 
 		 346 aa  90.5  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1649  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.49 
 
 		 370 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1676  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.5 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.945696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  29.3 
 
 		 470 aa  89.7  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3224  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.66 
 
 		 411 aa  89.7  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.841797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.2 
 
 		 338 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  24.84 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.14 
 
 		 352 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  34.66 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.14 
 
 		 352 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  27.14 
 
 		 352 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1235  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.5 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  27.48 
 
 		 382 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2482  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.73 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  34.55 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.9 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.16 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.57 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  25.8 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.75 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.75 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  38.68 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.85 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.687816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>