More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0547 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
324 aa  676    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  82.04 
 
 
331 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.53 
 
 
324 aa  354  1e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.21 
 
 
321 aa  353  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  49.24 
 
 
330 aa  320  9.999999999999999e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.4 
 
 
326 aa  294  2e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.3 
 
 
388 aa  139  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.31 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.48 
 
 
315 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  30.51 
 
 
345 aa  124  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.66 
 
 
364 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.39 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.39 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.39 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.24 
 
 
358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.39 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.39 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.39 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.39 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.07 
 
 
355 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.37 
 
 
362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.04 
 
 
355 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.04 
 
 
355 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.23 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  27.19 
 
 
343 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  29.23 
 
 
356 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.23 
 
 
356 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.08 
 
 
356 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  27.49 
 
 
355 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.93 
 
 
356 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  29.87 
 
 
358 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  27.69 
 
 
380 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.93 
 
 
356 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  30.77 
 
 
377 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  31.58 
 
 
350 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.95 
 
 
364 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  29.83 
 
 
334 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1064  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.08 
 
 
387 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.78 
 
 
363 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  26.71 
 
 
347 aa  99.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  30.06 
 
 
353 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.35 
 
 
338 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0964  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.92 
 
 
341 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  25 
 
 
437 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.61 
 
 
450 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14381  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  28.06 
 
 
436 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  26.99 
 
 
356 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3967  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.94 
 
 
347 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.56 
 
 
362 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.44 
 
 
345 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.84 
 
 
341 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  33.9 
 
 
407 aa  93.2  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3160  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.49 
 
 
347 aa  92.8  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  31.03 
 
 
366 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  27.54 
 
 
341 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  25.75 
 
 
452 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.32 
 
 
337 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3681  Rieske (2Fe-2S) region  33.13 
 
 
346 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.24 
 
 
433 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  28.78 
 
 
492 aa  90.5  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.24 
 
 
344 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174244  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  25.9 
 
 
331 aa  89.4  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3574  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.46 
 
 
341 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3642  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.46 
 
 
341 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55041  normal  0.365786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.8 
 
 
353 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3569  Rieske (2Fe-2S) region  31.46 
 
 
341 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  23.73 
 
 
367 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.45 
 
 
349 aa  87.8  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  30.64 
 
 
370 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.38 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  26.79 
 
 
358 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  29.55 
 
 
349 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25 
 
 
349 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  25.38 
 
 
359 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08501  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  32.64 
 
 
444 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  28.98 
 
 
358 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.9 
 
 
367 aa  85.9  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0218  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  31.94 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.163513  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09481  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  30.46 
 
 
448 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.056748  hitchhiker  0.0000260646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  32.11 
 
 
351 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  29.95 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.73 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  30.95 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  24.19 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  30.23 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.14 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  27.62 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  30.39 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  26.16 
 
 
347 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.89 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  25.24 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.65 
 
 
361 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.65 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08691  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  30.05 
 
 
440 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07721  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  30.48 
 
 
439 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.725202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  28.33 
 
 
348 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.49 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.38 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.61 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  29.44 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>