More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2143 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
372 aa  763    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.59 
 
 
373 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  48.22 
 
 
331 aa  295  9e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  36.53 
 
 
351 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  35.93 
 
 
359 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5871  hypothetical protein  40.24 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.789532  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.54 
 
 
344 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.43 
 
 
352 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  33.53 
 
 
345 aa  149  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5416  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  38.1 
 
 
283 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221202  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.18 
 
 
371 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3148  hypothetical protein  37.18 
 
 
288 aa  142  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1705  hypothetical protein  37.4 
 
 
287 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0851207  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1248  hypothetical protein  38.36 
 
 
284 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0789553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2081  hypothetical protein  38.36 
 
 
278 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.33 
 
 
364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1234  hypothetical protein  36.29 
 
 
286 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  0.493228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2067  hypothetical protein  31.91 
 
 
286 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0156668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.25 
 
 
358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.64 
 
 
337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
341 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  28.7 
 
 
334 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6468  hypothetical protein  35.68 
 
 
281 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5432  phenylpropionate dioxygenase  35 
 
 
288 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.82 
 
 
352 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  32.82 
 
 
352 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.36 
 
 
400 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.82 
 
 
352 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  27.08 
 
 
341 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.74 
 
 
338 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  26.38 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4462  hypothetical protein  36.05 
 
 
281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0193122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
353 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  31.12 
 
 
492 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.84 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
353 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.84 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.84 
 
 
327 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.17 
 
 
326 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  29 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  29.23 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  28.53 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.63 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  29.48 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  30.42 
 
 
382 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  30.74 
 
 
338 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.12 
 
 
362 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.73 
 
 
351 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  29.25 
 
 
349 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.5 
 
 
367 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  27.51 
 
 
342 aa  106  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.3 
 
 
352 aa  106  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  34.1 
 
 
347 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  26.79 
 
 
351 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  27.41 
 
 
373 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.73 
 
 
388 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.83 
 
 
358 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  27.81 
 
 
359 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  34.09 
 
 
349 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.25 
 
 
364 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.89 
 
 
324 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.02 
 
 
497 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.51 
 
 
355 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.65 
 
 
321 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.81 
 
 
359 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.02 
 
 
497 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.22 
 
 
355 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.94 
 
 
355 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.76 
 
 
363 aa  99.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  27.81 
 
 
359 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.81 
 
 
359 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2482  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.19 
 
 
362 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  27.11 
 
 
373 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  30.96 
 
 
348 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  23.05 
 
 
330 aa  99  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.07 
 
 
357 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.58 
 
 
347 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  30.67 
 
 
347 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  33.68 
 
 
361 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.22 
 
 
355 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3967  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.56 
 
 
347 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  34.44 
 
 
358 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.07 
 
 
354 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.14 
 
 
362 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.96 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.27 
 
 
357 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.16 
 
 
433 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.87 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5422  oxidoreductase protein  35.71 
 
 
230 aa  96.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  32.47 
 
 
343 aa  97.1  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.32 
 
 
355 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.44 
 
 
356 aa  96.3  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.32 
 
 
355 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.27 
 
 
357 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  27.87 
 
 
358 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  38.12 
 
 
477 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  29.54 
 
 
460 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  25.07 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.54 
 
 
361 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.96 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>