45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1234 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1234  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  0.493228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2067  hypothetical protein  95.8 
 
 		 286 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0156668 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5432  phenylpropionate dioxygenase  76.14 
 
 		 288 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5416  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  56.03 
 
 		 283 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221202  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1248  hypothetical protein  62.27 
 
 		 284 aa  333  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0789553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2081  hypothetical protein  61.9 
 
 		 278 aa  331  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3148  hypothetical protein  57.95 
 
 		 288 aa  312  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4462  hypothetical protein  50.36 
 
 		 281 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0193122 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6468  hypothetical protein  50 
 
 		 281 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5871  hypothetical protein  44.71 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.789532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1705  hypothetical protein  44.21 
 
 		 287 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0851207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.64 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.3 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.33 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  27.49 
 
 		 359 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  29.68 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.13 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.38 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  27.34 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.34 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.34 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.39 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.96 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.25 
 
 		 353 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  25.6 
 
 		 380 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.64 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  21.98 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  25.2 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0217  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.5 
 
 		 437 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.75 
 
 		 371 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.25 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  35.62 
 
 		 338 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  23.37 
 
 		 347 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  35.48 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.09 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  28.57 
 
 		 349 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.35 
 
 		 357 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  28.57 
 
 		 353 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  25.47 
 
 		 341 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 347 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  24.84 
 
 		 348 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  26.67 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.35 
 
 		 357 aa  42.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.260146  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 349 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0331823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>