More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0769 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  66.39 
 
 
499 aa  704    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
497 aa  1041    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  97.18 
 
 
497 aa  1018    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  40.49 
 
 
668 aa  399  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0964  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.49 
 
 
468 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  36.45 
 
 
443 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  35.43 
 
 
492 aa  248  2e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  36.09 
 
 
442 aa  246  9e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  34.19 
 
 
498 aa  233  5e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3793  pheophorbide a oxygenase  34.88 
 
 
443 aa  232  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3116  Pheophorbide a oxygenase  32.85 
 
 
442 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2189  Pheophorbide a oxygenase  34.06 
 
 
474 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  33.12 
 
 
477 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  33.26 
 
 
456 aa  216  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  32.59 
 
 
465 aa  210  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  36.82 
 
 
438 aa  210  6e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  32.86 
 
 
461 aa  209  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  31.78 
 
 
460 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40637  predicted protein  31.31 
 
 
510 aa  189  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.37 
 
 
450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.61 
 
 
450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.02 
 
 
372 aa  97.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.07 
 
 
373 aa  97.1  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.51 
 
 
331 aa  93.6  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.15 
 
 
362 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.71 
 
 
338 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2482  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.6 
 
 
362 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  31.84 
 
 
407 aa  89.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  28.69 
 
 
345 aa  89.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.76 
 
 
406 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  32.53 
 
 
353 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  28.92 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.94 
 
 
349 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  33.33 
 
 
369 aa  87.8  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  29.21 
 
 
349 aa  87.4  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  29.51 
 
 
366 aa  87  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.25 
 
 
449 aa  87  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  31.21 
 
 
380 aa  86.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  27.11 
 
 
338 aa  86.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.18 
 
 
406 aa  86.7  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2105  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.02 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.886658  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.18 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2244  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.02 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.937061  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  32.8 
 
 
334 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2050  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.02 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  24.52 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0622  putative Rieske (2Fe-2S) protein  41.46 
 
 
314 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0948094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  29.89 
 
 
452 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3154  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.8 
 
 
221 aa  85.5  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.647374  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  30.46 
 
 
452 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1064  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.44 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  31.9 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2331  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.26 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.57 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.52 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.15 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1241  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.52 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.635525  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.15 
 
 
355 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0488  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.66 
 
 
330 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.386184  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0390  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.66 
 
 
330 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  31.82 
 
 
431 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1818  putative Rieske iron-sulfur protein  38.66 
 
 
330 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.66 
 
 
330 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.55 
 
 
315 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.81 
 
 
367 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  32.96 
 
 
341 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  38.84 
 
 
347 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  31.93 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  29.35 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  26.7 
 
 
347 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.4 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  27.23 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.79 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.82 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.169671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2122  putative iron-sulphur protein  37.82 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  28.64 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  27.92 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  35.54 
 
 
436 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  26.88 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  28.8 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  30.22 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.71 
 
 
450 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  28.57 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  29.27 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  29.45 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  28.7 
 
 
356 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
373 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.73 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.52 
 
 
367 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
373 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.28 
 
 
370 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  29.31 
 
 
452 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  30.59 
 
 
371 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.82 
 
 
448 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  29.31 
 
 
438 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  32.95 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.49 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  37.1 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  36.05 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>