More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0805 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1818  putative Rieske iron-sulfur protein  98.79 
 
 
330 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
330 aa  658    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.169671  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  98.18 
 
 
330 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0390  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  98.79 
 
 
330 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2122  putative iron-sulphur protein  100 
 
 
330 aa  658    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0488  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  98.18 
 
 
330 aa  648    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.386184  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2331  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  70.13 
 
 
326 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2244  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  70 
 
 
332 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.937061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2105  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  70 
 
 
332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.886658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2050  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  70 
 
 
332 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0622  putative Rieske (2Fe-2S) protein  41.32 
 
 
314 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0948094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.8 
 
 
352 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  41.8 
 
 
352 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.8 
 
 
352 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  46.73 
 
 
358 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
347 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.82 
 
 
367 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  34.94 
 
 
345 aa  87.8  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.85 
 
 
374 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.85 
 
 
370 aa  86.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35581  predicted protein  35.87 
 
 
386 aa  85.9  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000902697  normal  0.474336 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  39.5 
 
 
492 aa  85.1  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  38.14 
 
 
440 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.29 
 
 
446 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.14 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  40.85 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.43 
 
 
371 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.14 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.21 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  40.43 
 
 
371 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.43 
 
 
371 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  39.86 
 
 
383 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.14 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.16 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.82 
 
 
497 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1706  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.42 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0736967  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.14 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  37.96 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.12 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  42.99 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.82 
 
 
497 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.39 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.72 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  39.02 
 
 
499 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  40.91 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.99 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.84 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.77 
 
 
433 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.76 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  29.17 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  35.9 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  39.25 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.12 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  40.91 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  44.14 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.91 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  33.83 
 
 
380 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.84 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.84 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.29 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  35.09 
 
 
668 aa  76.6  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  36.61 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  39.29 
 
 
359 aa  75.9  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  42.11 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  38.24 
 
 
350 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.17 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  44.21 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.58 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.18 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.05 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  40.95 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  37.38 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  39.05 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  42.06 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5422  oxidoreductase protein  40.18 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1459  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.92 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0280358  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.93 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  37.3 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.05 
 
 
448 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.72 
 
 
358 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.83 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  36.11 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  33.9 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.17 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  42.2 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  37.61 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40637  predicted protein  35.25 
 
 
510 aa  70.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  38.94 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  48.19 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  31.67 
 
 
452 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  39.36 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.54 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  32.5 
 
 
452 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1473  Rieske (2Fe-2S) region  34.26 
 
 
398 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.826795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  34.86 
 
 
417 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  35.78 
 
 
439 aa  69.3  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.25 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>