More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2688 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  100 
 
 
352 aa  711    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  42.12 
 
 
356 aa  257  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  38.5 
 
 
376 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1118  PrnD  38.46 
 
 
346 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2736  PrnD  38.46 
 
 
370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  38.46 
 
 
370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
374 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.15 
 
 
370 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  38.58 
 
 
373 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.87 
 
 
370 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  35.79 
 
 
334 aa  109  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.38 
 
 
352 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  41.38 
 
 
352 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.38 
 
 
352 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.57 
 
 
326 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.13 
 
 
338 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  35.22 
 
 
341 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  35.85 
 
 
348 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  44.86 
 
 
388 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.65 
 
 
364 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  40.31 
 
 
345 aa  99  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.59 
 
 
341 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.98 
 
 
359 aa  96.7  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.73 
 
 
337 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  31.25 
 
 
377 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.52 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  39.09 
 
 
359 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3307  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.46 
 
 
357 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3569  Rieske (2Fe-2S) region  32.24 
 
 
341 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.81 
 
 
332 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3642  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.24 
 
 
341 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55041  normal  0.365786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3574  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.24 
 
 
341 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.57 
 
 
362 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  28.71 
 
 
367 aa  92.8  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.39 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2053  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.07 
 
 
398 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216867  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  33.72 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07721  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  26.91 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.725202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.22 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270675  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  39.25 
 
 
358 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  44.55 
 
 
362 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.58 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.65 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.65 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.65 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.96 
 
 
347 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.65 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.52 
 
 
357 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0463  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.65 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.65 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  42.11 
 
 
452 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  32.93 
 
 
359 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  41.82 
 
 
437 aa  90.1  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  36.79 
 
 
315 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.13 
 
 
345 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.29 
 
 
327 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  31.89 
 
 
353 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.76 
 
 
385 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  35.22 
 
 
440 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  32.37 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.89 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.41 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  31.22 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5225  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.72 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.532387  normal  0.253584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.77 
 
 
353 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.63 
 
 
352 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.62 
 
 
358 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  31.98 
 
 
358 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  32.34 
 
 
358 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
460 aa  86.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  36.73 
 
 
438 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  29.69 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.14 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1533  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.12 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.37 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4728  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.33 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.14 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1769  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.61 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501014  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.05 
 
 
343 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4640  Rieske (2Fe-2S) region  31.33 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5022  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.33 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  30.1 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  30.61 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  29.07 
 
 
340 aa  84  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0296  Rieske (2Fe-2S) region  28.57 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1788  Rieske (2Fe-2S) region  32.61 
 
 
332 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.06 
 
 
519 aa  83.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1835  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.61 
 
 
332 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  32.93 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  42.57 
 
 
499 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  30.37 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  30.85 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4566  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.17 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0832436  normal  0.12498 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.37 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.43 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  30.27 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08501  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  26.32 
 
 
444 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.89 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>