More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5154 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  69.04 
 
 
448 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  68.05 
 
 
452 aa  655    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  66.67 
 
 
452 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
440 aa  918    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  74.14 
 
 
438 aa  694    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  67.13 
 
 
452 aa  651    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  61.47 
 
 
437 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  56.02 
 
 
484 aa  521  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  37.6 
 
 
436 aa  267  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  36.79 
 
 
417 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  34.47 
 
 
422 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  35.93 
 
 
406 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  33.1 
 
 
439 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  31.53 
 
 
440 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  31.83 
 
 
440 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  35.24 
 
 
470 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.66 
 
 
430 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1910  phthalate 4,5-dioxygenase, oxygenase subunit  33.25 
 
 
438 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.58 
 
 
410 aa  199  9e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.9 
 
 
446 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 
408 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 
408 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  31.48 
 
 
431 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.15 
 
 
443 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.91 
 
 
443 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.91 
 
 
443 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  31.2 
 
 
392 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  32.08 
 
 
454 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.92 
 
 
445 aa  187  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.06 
 
 
433 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.56 
 
 
449 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  31.14 
 
 
437 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4795  phthalate 4,5-dioxygenase  31.25 
 
 
412 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.86 
 
 
434 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4627  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.77 
 
 
417 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1473  Rieske (2Fe-2S) region  31.38 
 
 
398 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.826795  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.13 
 
 
519 aa  155  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.94 
 
 
380 aa  134  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.72 
 
 
358 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.53 
 
 
315 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.82 
 
 
364 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.62 
 
 
327 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  32.16 
 
 
334 aa  101  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  34.94 
 
 
345 aa  99.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  26.79 
 
 
363 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  35.37 
 
 
356 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  32.93 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  26.84 
 
 
355 aa  97.8  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  26.47 
 
 
355 aa  97.8  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.6 
 
 
355 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.13 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.6 
 
 
355 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.6 
 
 
355 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.6 
 
 
355 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.6 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.6 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.6 
 
 
355 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.56 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.06 
 
 
324 aa  95.5  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.06 
 
 
321 aa  95.1  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.42 
 
 
356 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  26.15 
 
 
356 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.15 
 
 
356 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.15 
 
 
356 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.71 
 
 
450 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  34.66 
 
 
376 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.17 
 
 
362 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  26.24 
 
 
358 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.88 
 
 
356 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.41 
 
 
355 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.53 
 
 
338 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
352 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
352 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.41 
 
 
355 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
352 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  35.22 
 
 
352 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.33 
 
 
367 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  39.37 
 
 
323 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0622  putative Rieske (2Fe-2S) protein  39.13 
 
 
314 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0948094 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0488  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.98 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.386184  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1818  putative Rieske iron-sulfur protein  38.98 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.98 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0390  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.98 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  26.92 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.19 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.14 
 
 
330 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.169671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2122  putative iron-sulphur protein  38.14 
 
 
330 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.02 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.3 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.14 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.45 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  38.02 
 
 
499 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  28.7 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  28.27 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  31.79 
 
 
423 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.5 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.3 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  27.07 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.79 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  27.03 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>